RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 CCDC142Q17RM4 750 aa6.78□□□□□ -1.32
GNPTAB-208ENST00000550718 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.78□□□□□ -1.32
GNPTAB-208ENST00000550718 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GNPTAB-208ENST00000550718 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.78□□□□□ -1.32
GNPTAB-208ENST00000550718 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.78□□□□□ -1.32
GNPTAB-208ENST00000550718 EDARQ9UNE0 448 aa6.78□□□□□ -1.32
GNPTAB-208ENST00000550718 CDKL5O76039 1030 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 SPDEFO95238 335 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ESRRBO95718 433 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 HSD3B2P26439 372 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 GUCY1A2P33402 732 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CHN2P52757 468 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CDK17Q00537 523 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 RESTQ13127 1097 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 PRR16Q569H4 304 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CAVIN3Q969G5 261 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 COX11Q9Y6N1 276 aa6.77□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 MAST3O60307 1309 aa6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 TLDC2A0PJX2 215 aa6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 SREBF1P36956 1147 aa6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 FOXI1Q12951 378 aa6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.76□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 KIAA0355O15063 1070 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CPEP16870 476 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 MALLQ13021 153 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 TP53BP2Q13625 1128 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 REPS2Q8NFH8 660 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ASB10Q8WXI3 467 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 BOD1Q96IK1 185 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 LANCL2Q9NS86 450 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 RNF181Q9P0P0 153 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 INSL6Q9Y581 213 aa6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 TEX33O43247 280 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ENDOD1O94919 500 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 MCAMP43121 646 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC5A3P53794 718 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 PPP3CAQ08209 521 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 SCAPQ12770 1279 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 MPP3Q13368 585 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 AFMIDQ63HM1 303 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 MRI1Q9BV20 369 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 TMX1Q9H3N1 280 aa6.74□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 UNC119BA6NIH7 251 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 EYA4O95677 639 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ELANEP08246 267 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 FDXRP22570 491 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 GCSHP23434 173 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CD38P28907 300 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 MPLP40238 635 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 MED25Q71SY5 747 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 NELL1Q92832 810 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.73□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 A0A1B0GTW7 788 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 POMCP01189 267 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 ATP5JP18859 108 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 MASP1P48740 699 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 PER3P56645 1201 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 MGAT2Q10469 447 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 STAT4Q14765 748 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 CMIPQ8IY22 773 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 UBR7Q8N806 425 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM140Q9NV12 185 aa6.72□□□□□ -1.33
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