RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa21.85■■□□□ 1.09
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CTDSP2-204ENST00000548823 NRDCO43847 1150 aa21.85■■□□□ 1.09
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CTDSP2-204ENST00000548823 CCZ1BP86790 482 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-204ENST00000548823 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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CTDSP2-204ENST00000548823 KCNJ12Q14500 433 aa21.84■■□□□ 1.09
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CTDSP2-204ENST00000548823 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.82■■□□□ 1.08
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.82■■□□□ 1.08
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CTDSP2-204ENST00000548823 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 SKILP12757 684 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 MTMR1Q13613 665 aa21.81■■□□□ 1.08
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.8■■□□□ 1.08
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CTDSP2-204ENST00000548823 CA8P35219 290 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 STAT5BP51692 787 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 DSC3Q14574 896 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 ABI1Q8IZP0 508 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 RDM1Q8NG50 284 aa21.79■■□□□ 1.08
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