RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541416.5

SNHG1-216, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-216	ENST00000541416	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	B4GALT5	O43286	388 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	KIF4A	O95239	1232 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	GLUL	P15104	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	KRT2	P35908	639 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	POTEM	A6NI47	508 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	NEMF	O60524	1076 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	NTHL1	P78549	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	LMNB2	Q03252	620 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RAB33A	Q14088	237 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	MAPK6	Q16659	721 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	LRRN2	O75325	713 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ECI2	O75521	394 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RECQL4	O94761	1208 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ELF1	P32519	619 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	OR1D2	P34982	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	TXK	P42681	527 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	NRL	P54845	237 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	SCRN1	Q12765	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	UROC1	Q96N76	676 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	FZD8	Q9H461	694 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	B3GAT3	O94766	335 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	LRG1	P02750	347 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	TRIM29	Q14134	588 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG1-216	ENST00000541416	ACKR2	O00590	384 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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