RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534617.5

BRMS1-209, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 905 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-209ENST00000534617 ADH1AP07327 375 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ALADP13716 330 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 PROZP22891 400 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CLCN4P51793 760 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 NCKAP1LP55160 1127 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 DSG1Q02413 1049 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ITIH3Q06033 890 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 NAB2Q15742 525 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 USP41Q3LFD5 358 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 KANK3Q6NY19 840 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 RNF135Q8IUD6 432 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 MYCT1Q8N699 235 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 FBXL18Q96ME1 805 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ADAM7Q9H2U9 754 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 PARVGQ9HBI0 331 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 MUTYHQ9UIF7 546 aa15.37■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 TEX28O15482 410 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 TOM1L1O75674 476 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 STK38Q15208 465 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 KIAA0319Q5VV43 1072 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ZPBP2Q6X784 338 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 SNX27Q96L92 541 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 RIPOR3Q96MK2 946 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ACAP3Q96P50 834 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 POMKQ9H5K3 350 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 MAN1C1Q9NR34 630 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CHST7Q9NS84 486 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 STK17AQ9UEE5 414 aa15.36■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 TRIP11Q15643 1979 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CITO14578 2027 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 BRD1O95696 1058 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 GLUD1P00367 558 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 MYBP10242 640 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 MTHFRP42898 656 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 LIG4P49917 911 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF131P52739 623 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 SLC39A14Q15043 492 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 SEZ6Q53EL9 994 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 RTP2Q5QGT7 225 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 RRAGBQ5VZM2 374 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CEP57Q86XR8 500 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 NECTIN4Q96NY8 510 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 RXFP1Q9HBX9 757 aa15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CLDN3O15551 220 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 TRAK2O60296 914 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 RPL17P18621 184 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 DDIT3P35638 169 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 STAT6P42226 847 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CLCNKBP51801 687 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CREMQ03060 361 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 DYMQ7RTS9 669 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 FEZF2Q8TBJ5 459 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 UROC1Q96N76 676 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 TTPALQ9BTX7 342 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 C11orf16Q9NQ32 467 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 SLC38A7Q9NVC3 462 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 TBX20Q9UMR3 447 aa15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 DENND4AQ7Z401 1863 aa15.33■□□□□ 0.05
BRMS1-209ENST00000534617 B3GAT3O94766 335 aa15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 SPATA31D3P0C874 917 aa15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 COL9A1P20849 921 aa15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 NMT1P30419 496 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 MCL1Q07820 350 aa15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 PSMD5Q16401 504 aa15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa15.33■□□□□ 0.04
BRMS1-209ENST00000534617 PALB2Q86YC2 1186 aa15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms