RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EPC1Q9H2F5 836 aa9.5□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KDM5CP41229 1560 aa9.5□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NPATQ14207 1427 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCDC154A6NI56 674 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FOXL1Q12952 345 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 D2HGDHQ8N465 521 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AFAP1Q8N556 730 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LOXL4Q96JB6 756 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LANCL2Q9NS86 450 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IPPQ9Y573 584 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AGLP35573 1532 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 REREQ9P2R6 1566 aa9.49□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PLA2R1Q13018 1463 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF623O75123 536 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SYN1P17600 705 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COMTP21964 271 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AKAP5P24588 427 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PTPN7P35236 360 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SREBF1P36956 1147 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HHEXQ03014 270 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HS1BP3Q53T59 392 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MDM1Q8TC05 714 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BORCS6Q96GS4 357 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ABCA6Q8N139 1617 aa9.48□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARHGAP5Q13017 1502 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ADCY6O43306 1168 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DTNBO60941 627 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RFPL1O75677 317 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CHPFQ8IZ52 775 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 Q8TCH9 128 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MYO5CQ9NQX4 1742 aa9.47□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 STC2O76061 302 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EDNRBP24530 442 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CYP2C19P33261 490 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC6A9P48067 706 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ICAM4Q14773 271 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CHST13Q8NET6 341 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM89AQ96GI7 184 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM140Q9NV12 185 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SCGB1D2O95969 90 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IL2RBP14784 551 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GNAT2P19087 354 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FLT3LGP49771 235 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LILRA6Q6PI73 481 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 REPS2Q8NFH8 660 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DEF6Q9H4E7 631 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TDP1Q9NUW8 608 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CPS1P31327 1500 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.45□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SGTAO43765 313 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MFAP3LO75121 409 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 POU2F2P09086 479 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PDCP20941 246 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GUCY1A2P33402 732 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SP140Q13342 867 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LDAHQ9H6V9 325 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CD248Q9HCU0 757 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.44□□□□□ -0.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZMYM3Q14202 1370 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms