RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 ALKAL1Q6UXT8 129 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PAGE5Q96GU1 130 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 ZBP1Q9H171 429 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 TLE6Q9H808 572 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM206Q9H813 350 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 MARCH5Q9NX47 278 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0B4J269 797 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 MYL1P05976 194 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 NRIP1P48552 1158 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CASP5P51878 434 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CUL4BQ13620 913 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.95■■□□□ 1.42
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PTPRK-222ENST00000532751 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CLDND1Q9NY35 253 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CNTN3Q9P232 1028 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 EYSQ5T1H1 3165 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CTSAP10619 480 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 KCNE1P15382 129 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CASP1P29466 404 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 NAB2Q15742 525 aa23.94■■□□□ 1.42
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PTPRK-222ENST00000532751 UROC1Q96N76 676 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
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PTPRK-222ENST00000532751 TADA2AO75478 443 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CXCL14O95715 111 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 SOD2P04179 222 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CXCL8P10145 99 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 KCNA1Q09470 495 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 HIDE1A8MVS5 230 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF202O95125 648 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 27.7
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PTPRK-222ENST00000532751 COL19A1Q14993 1142 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 DUSP6Q16828 381 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 FUT10Q6P4F1 479 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 EFHBQ8N7U6 833 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 HPS3Q969F9 1004 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 IRAK3Q9Y616 596 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 UBE4BO95155 1302 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 TISP43B9A030 160 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 PER2O15055 1255 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 FAM189A1O60320 539 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 URODP06132 367 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 EHHADHQ08426 723 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CD302Q8IX05 232 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 RABGGTAQ92696 567 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 TSPAN18Q96SJ8 248 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 EXOC1Q9NV70 894 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRK-222ENST00000532751 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
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