RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531951.5

PUF60-217, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 973 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-217ENST00000531951 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.48■□□□□ 0.87
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PUF60-217ENST00000531951 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 VAMP7P51809 220 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 EPHB4P54760 987 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 WNT7BP56706 349 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 SURF1Q15526 300 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.48■□□□□ 0.87
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PUF60-217ENST00000531951 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.48■□□□□ 0.87
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PUF60-217ENST00000531951 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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PUF60-217ENST00000531951 PARP2Q9UGN5 583 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.48■□□□□ 0.87
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PUF60-217ENST00000531951 RGS19P49795 217 aa20.47■□□□□ 0.87
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PUF60-217ENST00000531951 TMEM240Q5SV17 173 aa20.47■□□□□ 0.87
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PUF60-217ENST00000531951 ZNF365Q70YC5 407 aa20.47■□□□□ 0.87
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PUF60-217ENST00000531951 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 CD302Q8IX05 232 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 RNF169Q8NCN4 708 aa20.47■□□□□ 0.87
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PUF60-217ENST00000531951 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 ASB7Q9H672 318 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 SCN1AP35498 2009 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 COL4A6Q14031 1691 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 LACTBL1A8MY62 500 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 DLG4P78352 724 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 CLDN10P78369 228 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 MAN2A1Q16706 1144 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 XKR4Q5GH76 650 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 SLC35C1Q96A29 364 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 FAM212AQ96EL1 285 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 FNBP1Q96RU3 617 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.871e-9■■□□□ 14.2
PUF60-217ENST00000531951 RSAD1Q9HA92 442 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 KLK14Q9P0G3 267 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 CNTN3Q9P232 1028 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-217ENST00000531951 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
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PUF60-217ENST00000531951 TRIM49CP0CI26 452 aa20.45■□□□□ 0.86
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PUF60-217ENST00000531951 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.45■□□□□ 0.86
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PUF60-217ENST00000531951 RNF19AQ9NV58 838 aa20.45■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.45■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 FSD2A1L4K1 749 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 ARL5CA6NH57 179 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 INPPL1O15357 1258 aa20.44■□□□□ 0.86
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PUF60-217ENST00000531951 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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PUF60-217ENST00000531951 JADE1Q6IE81 842 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 WDR49Q8IV35 697 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.44■□□□□ 0.86
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PUF60-217ENST00000531951 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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PUF60-217ENST00000531951 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 DERAQ9Y315 318 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 C2CD2Q9Y426 696 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 PTPRJQ12913 1337 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.43■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.43■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 STX10O60499 249 aa20.43■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 NFICP08651 508 aa20.43■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 FGFR1P11362 822 aa20.43■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 TNNI1P19237 187 aa20.43■□□□□ 0.86
PUF60-217ENST00000531951 KCNJ6P48051 423 aa20.43■□□□□ 0.86
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