RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 EPHA7Q15375 998 aa15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 RTP2Q5QGT7 225 aa15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CEP57Q86XR8 500 aa15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NECAB1Q8N987 351 aa15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 SNX21Q969T3 373 aa15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 KXD1Q9BQD3 176 aa15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 PARP2Q9UGN5 583 aa15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 ACACBO00763 2458 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 TBX3O15119 743 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 LILRB5O75023 590 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CTDNEP1O95476 244 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NPTXRO95502 500 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 TUSC3Q13454 348 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP2R5DQ14738 602 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 HASPINQ8TF76 798 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 RABGGTAQ92696 567 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 TMX3Q96JJ7 454 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NFKBIZQ9BYH8 718 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 KLK14Q9P0G3 267 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB23Q9ULC3 237 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNH3Q9ULD8 1083 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 POU2F2P09086 479 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CD72P21854 359 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CYP4A11Q02928 519 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CAPSQ13938 189 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 AMHR2Q16671 573 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 UVSSAQ2YD98 709 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NEK8Q86SG6 692 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 ITFG1Q8TB96 612 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC7A14Q8TBB6 771 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CLDN23Q96B33 292 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 DYDC2Q96IM9 177 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 RGL1Q9NZL6 768 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 SPTBN2O15020 2390 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 STK36Q9NRP7 1315 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CASTOR2A6NHX0 329 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 DGAT1O75907 488 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NRLP54845 237 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 ST3GAL1Q11201 340 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 RTL10Q7L3V2 364 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 TPH2Q8IWU9 490 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NELL1Q92832 810 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1B0GUA9 196 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 ECI2O75521 394 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF4AO95239 1232 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 THP07101 528 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 ADCY1Q08828 1119 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 ST3GAL2Q16842 350 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 TSSK4Q6SA08 328 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 SLFN12Q8IYM2 578 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 DNASE1L2Q92874 299 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 AIFM3Q96NN9 605 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 GDE1Q9NZC3 331 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-202ENST00000525711 COL4A2P08572 1712 aa15.71■□□□□ 0.1
UBASH3B-202ENST00000525711 DCDC2BA2VCK2 349 aa15.7■□□□□ 0.1
UBASH3B-202ENST00000525711 ZBTB39O15060 712 aa15.7■□□□□ 0.1
UBASH3B-202ENST00000525711 B4GALT5O43286 388 aa15.7■□□□□ 0.1
UBASH3B-202ENST00000525711 ADRB1P08588 477 aa15.7■□□□□ 0.1
UBASH3B-202ENST00000525711 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
UBASH3B-202ENST00000525711 XBP1P17861 261 aa15.7■□□□□ 0.1
UBASH3B-202ENST00000525711 ARL2P36404 184 aa15.7■□□□□ 0.1
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB33AQ14088 237 aa15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms