RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	TH	P07101	528 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TNFSF9	P41273	254 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	STAT6	P42226	847 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CASP5	P51878	434 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	SMTN	P53814	917 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	KCNA1	Q09470	495 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	COASY	Q13057	564 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TUSC3	Q13454	348 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	XKR4	Q5GH76	650 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	FUT10	Q6P4F1	479 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	KCNN1	Q92952	543 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	SNX27	Q96L92	541 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	S1PR5	Q9H228	398 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TBX20	Q9UMR3	447 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	IRAK3	Q9Y616	596 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	SCN1A	P35498	2009 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TRIO	O75962	3097 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TSC2	P49815	1807 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CUTA	O60888	179 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TOM1L1	O75674	476 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CXCL8	P10145	99 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	MYB	P10242	640 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	MCF2	P10911	925 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CASP1	P29466	404 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TXLNA	P40222	546 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CLCNKB	P51801	687 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	GTF2B	Q00403	316 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	ZP2	Q05996	745 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	SPAG1	Q07617	926 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	MCL1	Q07820	350 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	STRN3	Q13033	797 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74	1e-9	■■■□□ 14.9
PABPC1-222	ENST00000523555	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	ZPBP2	Q6X784	338 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	SV2B	Q7L1I2	683 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TCHP	Q9BT92	498 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	STRA6	Q9BX79	667 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555		I3L4J1	428 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TEX28	O15482	410 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP1R37	O75864	691 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	PIGR	P01833	764 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	WEE2	P0C1S8	567 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CLCN4	P51793	760 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	DSG1	Q02413	1049 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	SUSD6	Q92537	303 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	DHX58	Q96C10	678 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	BICD1	Q96G01	975 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	ACAP3	Q96P50	834 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CHST7	Q9NS84	486 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CNTN3	Q9P232	1028 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	MYO10	Q9HD67	2058 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	CLDN3	O15551	220 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	TADA2A	O75478	443 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	UROD	P06132	367 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	IDE	P14735	1019 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	10.4	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	BRCC3	P46736	316 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	GLUD2	P49448	558 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PABPC1-222	ENST00000523555	LIG4	P49917	911 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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