RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510623.1

RHOBTB3-211, Transcript of Rho related BTB domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RHOBTB3, Length 333 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3-211ENST00000510623 SLC11A1P49279 550 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 GLUD2P49448 558 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 VAC14Q08AM6 782 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 GRM4Q14833 912 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 EML3Q32P44 896 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 CCDC157Q569K6 752 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 PPM1LQ5SGD2 360 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 MARCH8Q5T0T0 291 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 RGS22Q8NE09 1264 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 SPATA20Q8TB22 786 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 HIC2Q96JB3 615 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 GBP3Q9H0R5 595 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 ARMT1Q9H993 441 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 RXFP1Q9HBX9 757 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 CHST12Q9NRB3 414 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 STARD5Q9NSY2 213 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 TOR4AQ9NXH8 423 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 EBF1Q9UH73 591 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 MTMR7Q9Y216 660 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 APCP25054 2843 aa5.48□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 KNL1Q8NG31 2342 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 PTPRDP23468 1912 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 RRN3P2A6NIE6 340 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 CBFA2T3O75081 653 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 FCARP24071 287 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 MARK3P27448 753 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 CTHP32929 405 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 HOXD12P35452 270 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 HNF1BP35680 557 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 DCTP40126 519 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 SP4Q02446 784 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 DSC3Q14574 896 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 METTL7BQ6UX53 244 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 RABEPKQ7Z6M1 372 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 YAF2Q8IY57 180 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 NME8Q8N427 588 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 EXD3Q8N9H8 876 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 ZNF248Q8NDW4 579 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 TMEM40Q8WWA1 233 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 RSPH1Q8WYR4 309 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 CDC6Q99741 560 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 CAPN10Q9HC96 672 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 COL20A1Q9P218 1284 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 STAB1Q9NY15 2570 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.47□□□□□ -1.53
RHOBTB3-211ENST00000510623 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 MYBPHLA2RUH7 354 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 B4E1Z4 1266 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 SKIP12755 728 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 JUPP14923 745 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 PDE6AP16499 860 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 PTGER3P43115 390 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 MTX1Q13505 466 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 NEDD9Q14511 834 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 RTP5Q14D33 572 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 IGFBP7Q16270 282 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 CTR9Q6PD62 1173 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 LILRA6Q6PI73 481 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 DHRS13Q6UX07 377 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 VITQ6UXI7 678 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 FAM228AQ86W67 206 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 ERICH1Q86X53 443 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 TBC1D5Q92609 795 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.46□□□□□ -1.54
RHOBTB3-211ENST00000510623 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms