RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PROZP22891 400 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XKR4Q5GH76 650 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.6■□□□□ 0.25
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.59■□□□□ 0.25
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOM1L1O75674 476 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLA2G5P39877 138 aa16.59■□□□□ 0.25
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LILRA6Q6PI73 481 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZPBP2Q6X784 338 aa16.59■□□□□ 0.25
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNN1Q92952 543 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PBXIP1Q96AQ6 731 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACAP3Q96P50 834 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CXCL16Q9H2A7 254 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CACNG4Q9UBN1 327 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TGM5O43548 720 aa16.58■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B3GAT3O94766 335 aa16.58■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAPLNO95428 1278 aa16.58■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAPTP10636 758 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTMR3Q13615 1198 aa16.58■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RTP2Q5QGT7 225 aa16.58■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP57Q86XR8 500 aa16.58■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KREMEN2Q8NCW0 462 aa16.58■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RASSF8Q8NHQ8 419 aa16.58■□□□□ 0.24
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.58■□□□□ 0.24
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 UPP1Q16831 310 aa16.57■□□□□ 0.24
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HAUS6Q7Z4H7 955 aa16.57■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPBP1Q86WP2 473 aa16.57■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP120Q8N960 986 aa16.57■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.57■□□□□ 0.24
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLCG1P19174 1290 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FGFR3P22607 806 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDIT3P35638 169 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLCNKBP51801 687 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCKAP1LP55160 1127 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCL1Q07820 350 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMD5Q16401 504 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KYAT1Q16773 422 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAD54LQ92698 747 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNX27Q96L92 541 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLSTN3Q9BQT9 956 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 REEP2Q9BRK0 252 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PARVGQ9HBI0 331 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNTN3Q9P232 1028 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TECTAO75443 2155 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RFPL2O75678 378 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZMYND10O75800 440 aa16.55■□□□□ 0.24
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