RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504295.1

COPB2-204, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 2

Gene COPB2, Length 3,524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-204ENST00000504295 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 GATA6Q92908 595 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 GJA10Q969M2 543 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 CCDC102AQ96A19 550 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 CCDC17Q96LX7 622 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 NOD2Q9HC29 1040 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 PCNTO95613 3336 aa6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 STRNO43815 780 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 EXOC3O60645 756 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ATP2C2O75185 946 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 UNC5CO95185 931 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 NPTXRO95502 500 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 SCP2P22307 547 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 CHKAP35790 457 aa6.85□□□□□ -1.31
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COPB2-204ENST00000504295 DOK7Q18PE1 504 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 TRABD2AQ86V40 505 aa6.85□□□□□ -1.31
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COPB2-204ENST00000504295 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 C18orf8Q96DM3 657 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 RIT2Q99578 217 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 CHKBQ9Y259 395 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 SAMM50Q9Y512 469 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 CLUHO75153 1309 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 PROZP22891 400 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 NR2F2P24468 414 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 RAP1GDS1P52306 607 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 WNT7BP56706 349 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 RPS6KA1Q15418 735 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 LRRC38Q5VT99 294 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 DCLK3Q9C098 648 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 BATF3Q9NR55 127 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 PHACTR2O75167 634 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ENTPD3O75355 529 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 TOMM70O94826 608 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 TGDSO95455 350 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 FESP07332 822 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 STAT3P40763 770 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ADAM9Q13443 819 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.85□□□□□ -1.31
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COPB2-204ENST00000504295 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 LDHDQ86WU2 507 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 NRG4Q8WWG1 115 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ZNF516Q92618 1163 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 PPCSQ9HAB8 311 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 RRAGCQ9HB90 399 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 COL20A1Q9P218 1284 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ALG6Q9Y672 507 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.85□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.84□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.84□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 CAPN15O75808 1086 aa6.84□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 TTC4O95801 387 aa6.84□□□□□ -1.31
COPB2-204ENST00000504295 EDN1P05305 212 aa6.84□□□□□ -1.31
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