RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503791.5

PAN3-204, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

TSL 2

Gene PAN3, Length 2,443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-204ENST00000503791 Q4G0T1 1027 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 BBOF1Q8ND07 529 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 LMO3Q8TAP4 145 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 DENND1AQ8TEH3 1009 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 MAML1Q92585 1016 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 NYXQ9GZU5 481 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 EDF1O60869 148 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 GAS8O95995 478 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 RSPH10BP0C881 870 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 BTDP43251 543 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 MUM1Q2TAK8 710 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 SGO2Q562F6 1265 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 ANO3Q9BYT9 981 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 SENP1Q9P0U3 644 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-204ENST00000503791 PDHA1P08559 390 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SPARCL1Q14515 664 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 PDK4Q16654 411 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SESTD1Q86VW0 696 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 TDRPQ86YL5 185 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 C10orf82Q8WW14 230 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 FAM20AQ96MK3 541 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 UVRAGQ9P2Y5 699 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SPOPO43791 374 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 CYP1A2P05177 515 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 CETPP11597 493 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 EPHB2P29323 1055 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 HSPA1LP34931 641 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 FAM47EQ6ZV65 393 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SLC20A1Q8WUM9 679 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SCOCQ9UIL1 159 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 RASA4BC9J798 803 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 RASA4O43374 803 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SKIP12755 728 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 TM4SF1P30408 202 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SSR1P43307 286 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 ITGA8P53708 1063 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 MYBPC2Q14324 1141 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 LRRC8CQ8TDW0 803 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 NMRK1Q9NWW6 199 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 FOCADQ5VW36 1801 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 P4HA2O15460 535 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 ARHGAP44Q17R89 818 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 KIFAP3Q92845 792 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 C2CD2LO14523 706 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 ATF2P15336 505 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 C4orf50Q6ZRC1 276 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 TRABD2AQ86V40 505 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 FAM192AQ9GZU8 254 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 MEIS1O00470 390 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 HGSO14964 777 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 CHRNB2P17787 502 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 CYLDQ9NQC7 956 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 RGL1Q9NZL6 768 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 ANAPC5Q9UJX4 755 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 BFSP1Q12934 665 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 GRIK5Q16478 980 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 TUBB6Q9BUF5 446 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 TIPINQ9BVW5 301 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 DNAJC3Q13217 504 aa25.16■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 FAM210AQ96ND0 272 aa25.16■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.16■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 FOXO6A8MYZ6 492 aa25.16■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 LRRN2O75325 713 aa25.16■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 ENTPD5O75356 428 aa25.16■■□□□ 1.62
PAN3-204ENST00000503791 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms