RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497768.7

TATDN3-204, Transcript of TatD DNase domain containing 3, human

TSL 5

Gene TATDN3, Length 302 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TATDN3-204	ENST00000497768	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	FIBP	O43427	364 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PFKFB2	O60825	505 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	LRIG2	O94898	1065 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	HTR3B	O95264	441 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	MMP3	P08254	477 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	IFNAR1	P17181	557 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PDC	P20941	246 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PTGS1	P23219	599 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	ITGB7	P26010	798 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	ITGB8	P26012	769 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	NTF4	P34130	210 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	DDIT3	P35638	169 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	FPGS	Q05932	587 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	RBL2	Q08999	1139 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	SCRN1	Q12765	414 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	NEDD9	Q14511	834 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	ME3	Q16798	604 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	KAT2B	Q92831	832 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	COPS5	Q92905	334 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PHKB	Q93100	1093 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	NID2	Q14112	1375 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	STXBP3	O00186	592 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	B4GALT4	O60513	344 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	GGPS1	O95749	300 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	F2	P00734	622 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PFKM	P08237	780 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	MYL3	P08590	195 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	IMPDH2	P12268	514 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	RFC2	P35250	354 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	KRT2	P35908	639 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	EPHB4	P54760	987 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PSMC6	P62333	389 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	SP2	Q02086	613 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	BFSP2	Q13515	415 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	SHH	Q15465	462 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	NTRK3	Q16288	839 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TATDN3-204	ENST00000497768	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.25	□□□□□ -1.73

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