RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489485.5

CLDN11-209, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 2

Gene CLDN11, Length 1,854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-209ENST00000489485 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 RSAD1Q9HA92 442 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 FGFR1P11362 822 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 MLH1P40692 756 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 SHHQ15465 462 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 FAM186BQ8IYM0 893 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 CEP63Q96MT8 703 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 RNF19AQ9NV58 838 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 PTPRSQ13332 1948 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 LAMA3Q16787 3333 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 KCNJ18B7U540 433 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 PPP2R3AQ06190 1150 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 KCNJ12Q14500 433 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 ABI1Q8IZP0 508 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 HELQQ8TDG4 1101 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 ZFP42Q96MM3 310 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 GAD1Q99259 594 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 UBN1Q9NPG3 1134 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 ANK1P16157 1881 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 ARL5CA6NH57 179 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 ADRB2P07550 413 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 UVSSAQ2YD98 709 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 GLB1LQ6UWU2 654 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 CRIPAKQ8N1N5 446 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CLDN11-209ENST00000489485 HOXA2O43364 376 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 SPAG1Q07617 926 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 GLRA4Q5JXX5 417 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 CLLU1OSQ5K130 101 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 BRSK2Q8IWQ3 736 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 SNX27Q96L92 541 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 SLC9A7Q96T83 725 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 CXCL16Q9H2A7 254 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 PDE11AQ9HCR9 933 aa15.46■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 TTC26A0AVF1 554 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 LACTBL1A8MY62 500 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 AP5Z1O43299 807 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 OFD1O75665 1012 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 GNA14O95837 355 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 SERPINC1P01008 464 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 KRT13P13646 458 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 MRE11P49959 708 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 GATMP50440 423 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 CYP24A1Q07973 514 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 MFSD14AQ96MC6 490 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 FNBP1Q96RU3 617 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 MAPK13O15264 365 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 DGKIO75912 1065 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 IL18RAPO95256 599 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 POMCP01189 267 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 SCNN1GP51170 649 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 WNT7BP56706 349 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 FANCCQ00597 558 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 KRT31Q15323 416 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 RASIP1Q5U651 963 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 USP37Q86T82 979 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 YME1L1Q96TA2 773 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 ASB7Q9H672 318 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 GJB5O95377 273 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 TNNI1P19237 187 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 VAMP7P51809 220 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN11-209ENST00000489485 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms