RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CREMQ03060 361 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
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TRAPPC10-208ENST00000469521 XKR4Q5GH76 650 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 CES5AQ6NT32 575 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.65■□□□□ 0.9
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TRAPPC10-208ENST00000469521 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 TCHPQ9BT92 498 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.65■□□□□ 0.9
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ABCD1P33897 745 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYCT1Q8N699 235 aa20.64■□□□□ 0.89
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNTN3Q9P232 1028 aa20.63■□□□□ 0.89
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TRAPPC10-208ENST00000469521 UPP1Q16831 310 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 RTP2Q5QGT7 225 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 RNF135Q8IUD6 432 aa20.61■□□□□ 0.89
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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TRAPPC10-208ENST00000469521 TTPALQ9BTX7 342 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLCNKBP51801 687 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDXDC1Q6P996 788 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 POMKQ9H5K3 350 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDH22Q9UJ99 828 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 NR2E1Q9Y466 385 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPTLC2O15270 562 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR37L1O60883 481 aa20.59■□□□□ 0.89
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