RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 TERF2Q15554 542 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 TAF3Q5VWG9 929 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 EMBQ6PCB8 327 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 ZNF677Q86XU0 584 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 KRT12Q99456 494 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 CLDN3O15551 220 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 TOM1L1O75674 476 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 MARK3P27448 753 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 PIK3CAP42336 1068 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 AP3M2P53677 418 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 EPHB4P54760 987 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 WNT7BP56706 349 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 SLC7A5Q01650 507 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 TRIM50Q86XT4 487 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.18■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 HBP1O60381 514 aa20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 CYP1A2P05177 515 aa20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 CYP2C8P10632 490 aa20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 BPIFB4P59827 614 aa20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 BIRC3Q13489 604 aa20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 CLUL1Q15846 466 aa20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 EFCC1Q9HA90 598 aa20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 MED4Q9NPJ6 270 aa20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 PTPRJQ12913 1337 aa20.17■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 H3BQF6 201 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 FAM189A1O60320 539 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 VNN1O95497 513 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 CETPP11597 493 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 NNTQ13423 1086 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 ARMCX2Q7L311 632 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 ACP6Q9NPH0 428 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 GRIN3BO60391 1043 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 GLI1P08151 1106 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 KRT5P13647 590 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 MAPK6Q16659 721 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 PTPROQ16827 1216 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 COPS5Q92905 334 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 CAVIN3Q969G5 261 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 VTA1Q9NP79 307 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 ALG6Q9Y672 507 aa20.16■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 CLSTN1O94985 981 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 PRKCBP05771 671 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 GTF2A2P52657 109 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 TFDP1Q14186 410 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 WDR49Q8IV35 697 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 RNF149Q8NC42 400 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 23.5
NME4-210ENST00000468031 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 PLXNB2O15031 1838 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-210ENST00000468031 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 PDHXO00330 501 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 ASAP2O43150 1006 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 RAD51CO43502 376 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 MCL1Q07820 350 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 CUL2Q13617 745 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 LAMC2Q13753 1193 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 SURF1Q15526 300 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 FAM71BQ8TC56 605 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.14■□□□□ 0.81
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