RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GARTP22102 1010 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OSTNP61366 133 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RASGEF1CQ8N431 466 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AFAP1L1Q8TED9 768 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RUFY1Q96T51 708 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1orf112Q9NSG2 853 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYPNQ86TC9 1320 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GOLGA6CA6NDK9 693 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GOLGA6DP0CG33 693 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ECHS1P30084 290 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ICAM3P32942 547 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDR2Q01850 454 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RHOT2Q8IXI1 618 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEP89Q96ST8 783 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDGFCQ9NRA1 345 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPOPO43791 374 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSF2BPO75031 334 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VNN1O95497 513 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYP2C8P10632 490 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARL2P36404 184 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IREB2P48200 963 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CENPHQ9H3R5 247 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OTOFQ9HC10 1997 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CES2O00748 559 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TTMPQ5BVD1 217 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C9orf131Q5VYM1 1079 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FMNL3Q8IVF7 1028 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CAVIN3Q969G5 261 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C18orf8Q96DM3 657 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDCA5Q96FF9 252 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEP350Q5VT06 3117 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOP56O00567 594 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GRIN3BO60391 1043 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GJB6O95452 261 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PYGMP11217 842 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NAMPTP43490 491 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RTP1P59025 263 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF394Q53GI3 561 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CFAP58Q5T655 872 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FOXR1Q6PIV2 292 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM270Q6UE05 265 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP37Q86T82 979 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OPTNQ96CV9 577 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FGD4Q96M96 766 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SBF1O95248 1867 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TNFRSF8P28908 595 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGBP1P78318 339 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZACNQ401N2 412 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WDR44Q5JSH3 913 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNF149Q8NC42 400 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SEPT1Q8WYJ6 367 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PIK3R5Q8WYR1 880 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYFIP2Q96F07 1278 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AZI2Q9H6S1 392 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PMM2O15305 246 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EDNRBP24530 442 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSMD6Q15008 389 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAATS1Q7Z4T9 603 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ERO1BQ86YB8 467 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RHPN2Q8IUC4 686 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NLRP4Q96MN2 994 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CARD9Q9H257 536 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EFCC1Q9HA90 598 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NRBP2Q9NSY0 501 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SOCS7O14512 581 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CST3P01034 146 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RRM1P23921 792 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP1A2P50993 1020 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NEDD9Q14511 834 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 METTL7BQ6UX53 244 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEP120Q8N960 986 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZSWIM1Q9BR11 485 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANAPC7Q9UJX3 599 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUB1Q9Y5A7 615 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms