RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 DBF4BQ8NFT6 615 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCLYQ96I15 445 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CGRRF1Q99675 332 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 HTATIP2Q9BUP3 242 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNTG2Q9NY99 539 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX33O43247 280 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNNI1P19237 187 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CETN1Q12798 172 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC10A6Q3KNW5 377 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 NT5DC4Q86YG4 428 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PGBD4Q96DM1 585 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM212AQ96EL1 285 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERGIC2Q96RQ1 377 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM8AQ9HCN3 771 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa18.36■□□□□ 0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LACTBL1A8MY62 500 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 RECQL4O94761 1208 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITGA4P13612 1032 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PBX1P40424 430 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 MXI1P50539 228 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP3CAQ08209 521 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT39Q6A163 491 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 MFSD5Q6N075 450 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM199Q8N511 208 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX27Q96L92 541 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.35■□□□□ 0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DERAQ9Y315 318 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2CD2Q9Y426 696 aa18.35■□□□□ 0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 EOMESO95936 686 aa18.34■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PFKMP08237 780 aa18.34■□□□□ 0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 WNT7BP56706 349 aa18.34■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM189BP81408 668 aa18.34■□□□□ 0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CBWD3Q5JTY5 395 aa18.34■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CBWD5Q5RIA9 395 aa18.34■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNKSR3Q6P9H4 555 aa18.34■□□□□ 0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 VSTM4Q8IW00 320 aa18.34■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.34■□□□□ 0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CNTN3Q9P232 1028 aa18.34■□□□□ 0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C9IYK1 514 aa18.33■□□□□ 0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 AKAP5P24588 427 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 EXOC3L4Q17RC7 722 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUOXA2Q1HG44 320 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 XKR4Q5GH76 650 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 IQCDQ96DY2 449 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOL6Q9BWW8 343 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF39Q9H2S5 420 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.33■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.33■□□□□ 0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TNNC2P02585 160 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITGB8P26012 769 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM132DQ14C87 1099 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYCP1Q15431 976 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZACNQ401N2 412 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 JADE1Q6IE81 842 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 SV2AQ7L0J3 742 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB128Q7Z7B8 93 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 DRC7Q8IY82 874 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXL13Q8NEE6 735 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01599Q8WXQ3 324 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF516Q92618 1163 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDLIM2Q96JY6 352 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIK3Q9Y2K2 1263 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPRJQ12913 1337 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.31■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNE1P15382 129 aa18.31■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.31■□□□□ 0.52
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