RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RAP2BP61225 183 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM189BP81408 668 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MGAT2Q10469 447 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NOMO1Q15155 1222 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPDYE7PQ495Y7 208 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HECTD2Q5U5R9 776 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AFMIDQ63HM1 303 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 Q6YL49 198 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 Q6ZPA2 131 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SYT12Q8IV01 421 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VRK3Q8IV63 474 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DNAJC10Q8IXB1 793 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 REPS2Q8NFH8 660 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CYFIP2Q96F07 1278 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PHACTR3Q96KR7 559 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TOR3AQ9H497 397 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPR45Q9Y5Y3 372 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MARCH11A6NNE9 402 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LPXNO60711 386 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CDKL5O76039 1030 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LMNAP02545 664 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HKR1P10072 659 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TGM1P22735 817 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPR3P46089 330 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ALDH1A3P47895 512 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MTNR1BP49286 362 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ERVK-21P61565 698 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 Q6ZVL8 140 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MIGA2Q7L4E1 593 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CMIPQ8IY22 773 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR56A1Q8NGH5 318 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC35B2Q8TB61 432 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COG1Q8WTW3 980 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COQ10AQ96MF6 247 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MRI1Q9BV20 369 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNPEPQ9H4A4 650 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPC25Q9HBM1 224 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VTA1Q9NP79 307 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DMRT3Q9NQL9 472 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNF181Q9P0P0 153 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NOX1Q9Y5S8 564 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRIM75PA6NK02 468 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DRGXA6NNA5 263 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF185O15231 689 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPR32O75388 356 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FOSP01100 380 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 POMCP01189 267 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CFIP05156 583 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AGXTP21549 392 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BMP5P22003 454 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC16A1P53985 500 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CREMQ03060 361 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PPP3CAQ08209 521 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CLUL1Q15846 466 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CSRP2Q16527 193 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SEM1Q6ZVN7 128 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MED25Q71SY5 747 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC9A6Q92581 669 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CAVIN3Q969G5 261 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NEU1Q99519 415 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C7orf25Q9BPX7 421 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WDR11Q9BZH6 1224 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DNM3Q9UQ16 869 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PIPSLA2A3N6 862 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms