RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPSQ13938 189 aa4.3□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC181Q5TID7 509 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 CREG2Q8IUH2 290 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf69Q8N8R5 385 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 AFAP1L1Q8TED9 768 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 SCFD2Q8WU76 684 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.3□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 PNKPQ96T60 521 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 TCHPQ9BT92 498 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 ACP6Q9NPH0 428 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB20Q9NX57 234 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 EHD2Q9NZN4 543 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.3□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 CYP26A1O43174 497 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 EXTL3O43909 919 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 EDN1P05305 212 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 GJB1P08034 283 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC10A3P09131 477 aa4.29□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 ABCD1P33897 745 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBB4BP68371 445 aa4.29□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 PLCB4Q15147 1175 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 TAF3Q5VWG9 929 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 DPP9Q86TI2 863 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 PALB2Q86YC2 1186 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.29□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 METTL13Q8N6R0 699 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF149Q8NC42 400 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP8B4Q8TF62 1192 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.29□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 ARFGAP3Q9NP61 516 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 PMM2O15305 246 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 ADCY3O60266 1144 aa4.29□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 PAFAH1B1P43034 410 aa4.29□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 KIF22Q14807 665 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPRNQ16849 979 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 IER5Q5VY09 327 aa4.29□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB33Q86T24 672 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF516Q92618 1163 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 MS4A14Q96JA4 679 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 AGPAT1Q99943 283 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 COQ4Q9Y3A0 265 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 CLDN3O15551 220 aa4.29□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 CLCN3P51790 818 aa4.29□□□□□ -1.72
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LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS6KA1Q15418 735 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 MEI1Q5TIA1 1274 aa4.29□□□□□ -1.72
LRRTM4-201ENST00000409088 EFCAB12Q6NXP0 572 aa4.29□□□□□ -1.72
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