RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 PNMA1Q8ND90 353 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.571e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERP27Q96DN0 273 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TLR10Q9BXR5 811 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 NOTOA8MTQ0 251 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 CYTH3O43739 400 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAMTA2O94983 1202 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 GJB6O95452 261 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 BMP15O95972 392 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC34A1Q06495 639 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 KAZNQ674X7 775 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP29Q9HBJ7 922 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM260Q9NX78 707 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLAIN2Q9P270 581 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TTI1O43156 1089 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBL4AP11441 157 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCSK6P29122 969 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 WASHC5Q12768 1159 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPA17Q15506 151 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 GRIK5Q16478 980 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANKDD1AQ495B1 522 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERP44Q9BS26 406 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 E9PBE3 544 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNFRSF10AO00220 468 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 VILLO15195 856 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDAH1O94760 285 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSPY3P0CV98 308 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSPY8P0CW00 308 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 HOXD13P35453 343 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSPY1Q01534 308 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 AP1B1Q10567 949 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP2R5CQ13362 524 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 MTMR3Q13615 1198 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 NR1D2Q14995 579 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC174Q6PII3 467 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 BBS5Q8N3I7 341 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 ESX1Q8N693 406 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 SKA1Q96BD8 255 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 BCORQ6W2J9 1755 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 O00370 1275 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 ECE2O60344 883 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 SRGNP10124 158 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 LONP1P36776 959 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD300CQ08708 224 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCSK7Q16549 785 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYLK3Q32MK0 819 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMTC4Q5T4D3 741 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 ISLR2Q6UXK2 745 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 RRAGAQ7L523 313 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 NUP93Q8N1F7 819 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 P2RX5Q93086 422 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNX25Q9H3E2 840 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 AZI2Q9H6S1 392 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 SH2D4AQ9H788 454 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRKAG3Q9UGI9 489 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms