RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 SGSM3Q96HU1 749 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 AAASQ9NRG9 546 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 RAB20Q9NX57 234 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 ASNSP08243 561 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CNGA1P29973 690 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 GCNT1Q02742 428 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 MSL1Q68DK7 614 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 FAM83AQ86UY5 434 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 FAM81BQ96LP2 452 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 WDR64B1ANS9 1081 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 ITIH2P19823 946 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CHRNA5P30532 468 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 KCNJ1P48048 391 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R7Q15435 360 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CNGA2Q16280 664 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CYB5D1Q6P9G0 228 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC34Q8IZ02 419 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SERPINB12Q96P63 405 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM150BA6NC51 233 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM23A6NLE4 172 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CLDN3O15551 220 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 NPTX2P47972 431 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 KRT76Q01546 638 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 KRT17Q04695 432 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 PTK6Q13882 451 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SGO2Q562F6 1265 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 RDM1Q8NG50 284 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 MAGEC3Q8TD91 643 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SAAL1Q96ER3 474 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 MYBL1P10243 752 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CYP24A1Q07973 514 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC91Q7Z6B0 441 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SLC12A4Q9UP95 1085 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CCNE2O96020 404 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SLC1A1P43005 524 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CAV1Q03135 178 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 PTP4A2Q12974 167 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 PGM5Q15124 567 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 XKR9Q5GH70 373 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 LPAR1Q92633 364 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM11Q96F44 468 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SAMD15Q9P1V8 674 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 IVDP26440 423 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 NSMFQ6X4W1 530 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SV2AQ7L0J3 742 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF677Q86XU0 584 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SNF8Q96H20 258 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 HAUS2Q9NVX0 235 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 DENND3A2RUS2 1198 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 TCEA3O75764 348 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 ATP5DP30049 168 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 MAPK4P31152 587 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SLCO1A2P46721 670 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 GRK7Q8WTQ7 553 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SH2D3AQ9BRG2 576 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 OAS1P00973 400 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 OGFOD1Q8N543 542 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SNCBQ16143 134 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 ANO5Q75V66 913 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf54Q8WWF1 131 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms