RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303927.3

CAVIN3-201, Transcript of caveolae associated protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAVIN3, Length 1,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3-201ENST00000303927 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TOM1L1O75674 476 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 POMCP01189 267 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 MCF2P10911 925 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 PROZP22891 400 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CA8P35219 290 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CASP10Q92851 521 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 BICD1Q96G01 975 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TMEM169Q96HH4 297 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ZFP42Q96MM3 310 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 FIZ1Q96SL8 496 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 GBP3Q9H0R5 595 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CDT1Q9H211 546 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 SNTG2Q9NY99 539 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 RECQL4O94761 1208 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 IDEP14735 1019 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CMA1P23946 247 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 SCNN1GP51170 649 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 GTF2BQ00403 316 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 GRIK3Q13003 919 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 SFR1Q86XK3 245 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 HVCN1Q96D96 273 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 NR1I2O75469 434 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 DDHD2O94830 711 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 PIGRP01833 764 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 GALTP07902 379 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 GRM5P41594 1212 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TRIM9Q9C026 710 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 PANK4Q9NVE7 773 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 KLK14Q9P0G3 267 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 STK39Q9UEW8 545 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CDH22Q9UJ99 828 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 GDAQ9Y2T3 454 aa21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ABLIM1O14639 778 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CLDN3O15551 220 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ALDH2P05091 517 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 SLC11A1P49279 550 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 LIG4P49917 911 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 DSC1Q08554 894 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 SIGLEC14Q08ET2 396 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 PTPN21Q16825 1174 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 VPS52Q8N1B4 723 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 STAMQ92783 540 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ZBP1Q9H171 429 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 MIOSQ9NXC5 875 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 USP25Q9UHP3 1055 aa21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 A0A1W2PQ27 194 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 A0A1W2PQ64 194 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 A0A1W2PQD8 194 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 CXCL14O95715 111 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 PFKFB1P16118 471 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 MCL1Q07820 350 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 ALCAMQ13740 583 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 ZBTB33Q86T24 672 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 IGSF21Q96ID5 467 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 NR2E1Q9Y466 385 aa21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3-201ENST00000303927 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms