RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294161.10

TTC9C-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC9C, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9C-201ENST00000294161 GTF3C4Q9UKN8 822 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 ALG6Q9Y672 507 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 LRRIQ4A6NIV6 560 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 FGGP02679 453 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 CHRNB2P17787 502 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 STAT5BP51692 787 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 EFNA5P52803 228 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 SOX10P56693 466 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 SP2Q02086 613 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 CNTN2Q02246 1040 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 SEPT1Q8WYJ6 367 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 KAT5Q92993 513 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 RUNDC3BQ96NL0 473 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 PLVAPQ9BX97 442 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 AP1M1Q9BXS5 423 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 AZI2Q9H6S1 392 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 FAM187AA6NFU0 413 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 CYP1A2P05177 515 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 MYBL1P10243 752 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 TNNI1P19237 187 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 APLP1P51693 650 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 AP3M2P53677 418 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 TCP11Q8WWU5 503 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 TMEM143Q96AN5 459 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 SH3GL2Q99962 352 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 HINFPQ9BQA5 517 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 BTBD7Q9P203 1132 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 AGPSO00116 658 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 ERLIN2O94905 339 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 KRT5P13647 590 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 CAPN2P17655 700 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 GLRA2P23416 452 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 GYS2P54840 703 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 FMO1Q01740 532 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 MTMR3Q13615 1198 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 METTL7BQ6UX53 244 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 SLC47A2Q86VL8 602 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 PALB2Q86YC2 1186 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 ZSWIM1Q9BR11 485 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 COG5Q9UP83 839 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.86■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 ERICH4A6NGS2 130 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 SORBS3O60504 671 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 MMEP08473 750 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 ATP4AP20648 1035 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 OSBPP22059 807 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 GBP1P32455 592 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 PIK3CAP42336 1068 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 PTENP60484 403 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 BIRC3Q13489 604 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 PTPROQ16827 1216 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 ZACNQ401N2 412 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 IER5Q5VY09 327 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 ZPBP2Q6X784 338 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 TRIM72Q6ZMU5 477 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF653Q96CK0 615 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 MSTO1Q9BUK6 570 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 MTUS1Q9ULD2 1270 aa15.85■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.84■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.84■□□□□ 0.13
TTC9C-201ENST00000294161 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms