RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 SCNM1Q9BWG6 230 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 GLT8D2Q9H1C3 349 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 hCG_1984214I3L0E3 225 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CHMLP26374 656 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 UVSSAQ2YD98 709 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 XKR3Q5GH77 459 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 WDR44Q5JSH3 913 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZS52 159 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TMTC2Q8N394 836 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 RABGGTAQ92696 567 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 BARHL2Q9NY43 387 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 HES2Q9Y543 173 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.36■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS3O15072 1205 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 RHOP08100 348 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SFNP31947 248 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CIITAP33076 1130 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 LIFRP42702 1097 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 JAK3P52333 1124 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 FUT2Q10981 343 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TTPALQ9BTX7 342 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CACNG4Q9UBN1 327 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa18.35■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 APC2O95996 2303 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TRIP11Q15643 1979 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CHMP2AO43633 222 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CCNE1P24864 410 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MPLP40238 635 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TCEAL6Q6IPX3 200 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 KBTBD6Q86V97 674 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MICU3Q86XE3 530 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 GAB3Q8WWW8 586 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TCEAL3Q969E4 200 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM87BQ96K49 555 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.34■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ARNTLO00327 626 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 MSH4O15457 936 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TADA2AO75478 443 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 GDI1P31150 447 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 GRIK3Q13003 919 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 RAB33AQ14088 237 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC32Q14392 662 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS36Q5K4E3 855 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 VITQ6UXI7 678 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 RTL10Q7L3V2 364 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SLC12A7Q9Y666 1083 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ABCA7Q8IZY2 2146 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 NCANO14594 1321 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SGSM2O43147 1006 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 PSMC3P17980 439 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 FAM171A1Q5VUB5 890 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ANO5Q75V66 913 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 HASPINQ8TF76 798 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ASB16Q96NS5 453 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 RIT2Q99578 217 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 EDEM2Q9BV94 578 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 VPS45Q9NRW7 570 aa18.32■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 GAS7O60861 476 aa18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 KIF4AO95239 1232 aa18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CD44P16070 742 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 MCM5P33992 734 aa18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 RDM1Q8NG50 284 aa18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SLC5A5Q92911 643 aa18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC51Q96ER9 411 aa18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 APOL6Q9BWW8 343 aa18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ASXL3Q9C0F0 2248 aa18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 PI4KAP42356 2102 aa18.31■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 C4orf47A7E2U8 309 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 EDIL3O43854 480 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN1O60635 241 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 OR1D2P34982 312 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 LRCH2Q5VUJ6 765 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms