RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 CASQ1P31415 396 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TERF1P54274 439 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MTFR1Q15390 333 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 AADACL2Q6P093 401 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM270Q6UE05 265 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC102AQ96A19 550 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 VNN1O95497 513 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GNA14O95837 355 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ASGR1P07306 291 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RHOXF2BP0C7M4 288 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 COG1Q8WTW3 980 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SCN1AP35498 2009 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KIF5CO60282 957 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LGR5O75473 907 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RGS2P41220 211 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 STAT1P42224 750 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PIK3CAP42336 1068 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KIF5AQ12840 1032 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MFSD10Q14728 455 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MEA1Q16626 185 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 IER5Q5VY09 327 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 HASPINQ8TF76 798 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ERLIN2O94905 339 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KRT39Q6A163 491 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 AFAP1L1Q8TED9 768 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MGAMO43451 1857 aa7.1□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TOM1L1O75674 476 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NPTXRO95502 500 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MUTP22033 750 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PTENP60484 403 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KCNA10Q16322 511 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 C7orf31Q8N865 590 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NUP58Q9BVL2 599 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 THAP2Q9H0W7 228 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NAGPAQ9UK23 515 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM17Q9Y577 477 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ADGRA2Q96PE1 1338 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 A6NJR5 290 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LACTBL1A8MY62 500 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ITGB3P05106 788 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RARBP10826 455 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GHRP10912 638 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GJC1P36383 396 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GPC3P51654 580 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RAET1EQ8TD07 263 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 F8W810 466 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 I3L4J1 428 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 STAG3L1P0CL83 205 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GALCP54803 685 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NOGQ13253 232 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 IQSEC1Q6DN90 963 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TRPV6Q9H1D0 765 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PALMO75781 387 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PSEN2P49810 448 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SREBF2Q12772 1141 aa7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NCOA4Q13772 614 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms