RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031775.12

Cald1-201, Transcript of Caldesmon 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Cald1, Length 2,142 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1-201ENSMUST00000031775 KaznQ69ZS8 779 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Zcwpw1Q6IR42 630 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Tor4aQ8BH02 426 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 OgtQ8CGY8 1046 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Cpa5Q8R4H4 436 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Usp15Q8R5H1 981 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Zfp64Q99KE8 643 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Six6os1Q9CTN5 574 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Rfx5Q9JL61 658 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Znhit2Q9QY66 399 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Arid2E9Q7E2 1828 aa15.5■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Slc35g2D3YVE8 412 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Vmn2r77L7N2B7 854 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Tnfrsf18O35714 228 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Hoxc6P10629 235 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Ap1m1P35585 423 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Grm2Q14BI2 872 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Cul4aQ3TCH7 759 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Rnf180Q3U827 592 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 LppQ8BFW7 613 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Qsox1Q8BND5 748 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Tbx22Q8K402 517 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Spns2Q91VM4 549 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Snx29Q9D3S3 818 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 IscuQ9D7P6 168 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Tanc1Q0VGY8 1856 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Rap1gapA2ALS5 663 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Gm10801F7C7Q0 168 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Kng1O08677 661 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 IapP03975 557 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Mgat3Q10470 538 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 HarsQ61035 509 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 RimklbQ80WS1 387 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Pxylp1Q8BHA9 480 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Mettl24Q8CCB5 363 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Lamtor4Q8CF66 99 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Epn2Q8CHU3 595 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Rnf25Q9QZR0 456 aa15.49■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 4933406M09RikG3XA12 479 aa15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 ChkbO55229 394 aa15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Cdc25cP48967 447 aa15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Arf4P61750 180 aa15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Tfdp1Q08639 410 aa15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Q6GQV0 436 aa15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 H2-Q4Q8HWB2 354 aa15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Commd10Q8JZY2 202 aa15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Rnf14Q9JI90 485 aa15.48■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Gm2030D3Z7C4 212 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Gimd1E9PW74 217 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Gm17535J3KMR8 224 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Mucl2P02815 138 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Vamp7P70280 220 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Klhl7Q8BUL5 586 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Vmn1r218Q8R261 298 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Ttc1Q91Z38 292 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Mis12Q9CY25 206 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Rab11fip1Q9D620 645 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Tekt1Q9DAJ2 418 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 DgkiD3YWQ0 1071 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Rbp3P49194 1234 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Gdpd4Q3TT99 632 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Nr2e1Q64104 385 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Ssxb10Q6XAR7 170 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Slc38a7Q8BWH0 463 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Scrn2Q8VCA8 425 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Cfap57Q9D180 1249 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Rexo2Q9D8S4 237 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Rilpl1Q9JJC6 406 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa15.47■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Tlk2O55047 718 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Rnaseh1O70338 285 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 IppP28575 584 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 PtpreP49446 699 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Ccr5P51682 354 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Hace1Q3U0D9 909 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Skap2Q3UND0 358 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Olfr392Q7TRX6 312 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 LarsQ8BMJ2 1178 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Ppme1Q8BVQ5 386 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Cog3Q8CI04 820 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Msgn1Q9JK54 188 aa15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Cald1-201ENSMUST00000031775 PgfP49764 158 aa15.46■□□□□ 0.06
Cald1-201ENSMUST00000031775 Cdh8P97291 799 aa15.46■□□□□ 0.06
Cald1-201ENSMUST00000031775 ItgadQ3V0T4 1168 aa15.46■□□□□ 0.06
Cald1-201ENSMUST00000031775 Samhd1Q60710 627 aa15.46■□□□□ 0.06
Cald1-201ENSMUST00000031775 Usp6nlQ80XC3 819 aa15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.3 ms