RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Apol10aQ8CCA5 318 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Depdc1aQ8CIG0 804 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Haus8Q99L00 373 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc70Q9D9B0 223 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Disp2Q8CIP5 1345 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NynrinQ5DTZ0 1840 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Akap17bA2A3V1 959 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tpp1O89023 562 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tp53P02340 387 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cst8P32766 142 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cxcr2P35343 359 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pik3caP42337 1068 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Akr1b8P45377 316 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ugt1a2P70691 533 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SlmapQ3URD3 845 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Asap3Q5U464 904 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccpg1Q640L3 753 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Srrm3Q80WV7 648 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Armc6Q8BNU0 468 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tyw3Q8BSA9 257 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zmynd10Q99ML0 440 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 IqcdQ9D3V1 458 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tjp3Q9QXY1 905 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sucla2Q9Z2I9 463 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt27Q9Z320 448 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm1141B9EJU1 475 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2b10P12791 500 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp781Q0P5U5 243 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam83hQ148V8 1209 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spata24Q6P926 205 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Usp49Q6P9L4 685 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ckap2lQ7TS74 745 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 H2-Q4Q8HWB2 354 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ror2Q9Z138 944 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mzf1S4R1L6 814 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NrapQ80XB4 1728 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Myh8P13542 1937 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Has3O08650 554 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ByslO54825 436 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01734 135 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rab21P35282 222 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cfap206Q6PE87 622 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GypcQ78HU7 95 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc7aQ8BGB2 858 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcns3Q8BQZ8 491 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam204aQ8C6C7 236 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdha12Q91Y18 950 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rnf181Q9CY62 165 aa9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Phkg1P07934 388 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Oprl1P35377 367 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hsd17b1P51656 344 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp943Q6NZP4 507 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MtrrQ8C1A3 696 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ctage5Q8R311 779 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tex13bQ99MW5 186 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 StambpQ9CQ26 424 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Scn10aQ6QIY3 1958 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Usp17ldG5E8G2 545 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Usp17lcG5E8I7 545 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Apba3O88888 571 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 S100a5P63084 93 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smad1P70340 465 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pou2f2Q00196 463 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PRAG1Q571I4 1179 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tnni3kQ5GIG6 834 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ThrspQ62264 150 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdhb14Q6PB90 796 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 IqceQ6PCQ0 778 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SpopQ6ZWS8 374 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Elmo3Q8BYZ7 720 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem60Q8K174 133 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spata4Q8K3V1 295 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rhobtb2Q91V93 728 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kdm4bQ91VY5 1086 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Taf11Q99JX1 211 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf687Q9D2D7 1237 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Thap2Q9D305 217 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 LrmdaQ9D9B4 229 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt71Q9R0H5 524 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Myh14Q6URW6 2000 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nup62clA2AG10 272 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wdr72D3YYM4 1114 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem132bF7BAB2 1078 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gsta4P24472 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zscan2Q07230 614 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnph1Q80VJ3 173 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp438Q8BFX2 798 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cep128Q8BI22 1102 aa9.5□□□□□ -0.89
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22 ms