RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J IES6P32617 166 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J MTC7P32633 139 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL102CP34249 101 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J AST1P35183 429 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SDS22P36047 338 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YPK3P38070 525 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J TAT1P38085 619 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ICS2P38284 255 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YND1P40009 630 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PUG1P40100 303 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J DLS1P40366 167 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J AGE2P40529 298 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J GZF3P42944 551 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J GON7P46984 123 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP33P46998 180 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J AVT4P50944 713 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J MTL1P53214 551 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J AAH1P53909 347 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J NRK1P53915 240 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SAM50P53969 484 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ENA2Q01896 1091 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J NOG1Q02892 647 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR248CQ03786 193 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J DLT1Q04216 342 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR283WQ05867 314 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR098CQ06089 161 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR345WQ06137 509 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR346CQ06139 101 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ASR1Q06834 288 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J GSH2Q08220 491 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ISA2Q12425 185 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J EAF3Q12432 401 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ENA5Q12691 1091 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SOD2P00447 233 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO4P07270 312 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SAG1P20840 650 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J FUN26P31381 517 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ACH1P32316 526 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP21P32524 280 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J REC114P32841 428 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YOX1P34161 385 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J MTH1P35198 433 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM4P36156 370 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR041WP37265 110 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J NAT2P37293 288 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI18P38211 433 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ARC40P38328 384 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SSH1P38353 490 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J OSH7P38755 437 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PMT6P42934 759 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PIR5P46999 287 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR120WP47157 116 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J TAF4P50105 388 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL159WP53110 370 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J MRH4P53166 561 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR005CQ02203 525 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC19Q03954 165 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J GAL83Q04739 417 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR252CQ04814 134 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J MRX10Q05648 414 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J FRE3Q08905 711 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J FCY1Q12178 158 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J RFM1Q12192 310 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR1Q12458 312 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR161W-CQ3E744 92 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J GCD1P09032 578 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YER190C-BP0CX94 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL077W-AP0CX95 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR296C-BP0CX96 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL283W-BP0CX97 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR204C-AP0CX98 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YFL068WP0CX99 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YLL066W-AP0CY00 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YLL067W-AP0CY01 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP10P18496 279 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J IDP1P21954 428 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J DAL3P32459 195 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ECT1P33412 323 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J MTC2P34246 357 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J TMA19P35691 167 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J RCN1P36054 211 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J THI2P38141 450 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ALG14P38242 237 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J LNP1P38878 278 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM46P38885 310 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PSD1P39006 500 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM1P39715 212 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J NTA1P40354 457 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SNL1P40548 159 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YFL015CP43578 164 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J CCC1P47818 322 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PUS4P48567 403 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J LYS20P48570 428 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PMT5P52867 743 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL114WP53134 725 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SCW11P53189 542 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J POP6P53218 158 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR152CP54072 576 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J HHT1P61830 136 aa2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms