RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeastyeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1YOL013C YKL075CP36083 450 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C AME1P38313 324 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C CUE1P38428 203 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C RCK1P38622 512 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SRP14P38985 146 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C GAB1P41733 394 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C NBP35P52920 328 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C MSO1P53604 210 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SNO1Q03144 224 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YPR091CQ06833 770 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C RSA1Q08932 381 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YLR126CQ12288 251 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C DNF2Q12675 1612 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C IQG1Q12280 1495 aa2.8□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C ASP3-2P0CX77 362 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C ASP3-3P0CX78 362 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C ASP3-4P0CX79 362 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C ASP3-1P0CZ17 362 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C CTA1P15202 515 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C FUN26P31381 517 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C DEP1P31385 405 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C GPX1P36014 167 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C PMU1P36069 295 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C NAT2P37293 288 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C GOS1P38736 223 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C RPR2P40571 144 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C NCA3P46955 337 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C NUP57P48837 541 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YLR152CP54072 576 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SCW10Q04951 389 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C COQ10Q08058 207 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C ESA1Q08649 445 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C RRS1Q08746 203 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C MCT1Q12283 360 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YSP2Q06681 1438 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C NUP192P47054 1683 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C TRP1P00912 224 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C PUT1P09368 476 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C URA6P15700 204 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C GIT1P25346 518 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C ATG15P25641 520 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C TRS65P32893 560 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data2.79□□□□□ -1.96not detected
HRD1YOL013C CHL4P38907 458 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C VAB2P40003 282 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YIL029CP40538 142 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C WSC2P53832 503 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YNL140CP53910 189 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C CRZ1P53968 678 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YML096WQ04489 525 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YPR098CQ06089 161 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C MMT2Q08970 484 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YPL150WQ12152 901 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C PRM4Q12498 284 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C CAT8P39113 1433 aa2.79□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SRB8P25648 1427 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SNA3P14359 133 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C CPT1P17898 393 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C MIR1P23641 311 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YCR025CP25352 136 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SEC1P30619 724 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SGE1P33335 543 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C FES1P38260 290 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C COG3P40094 801 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C PRE6P40303 254 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SNZ3P43545 298 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YJR085CP47131 105 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C MIG2P53035 382 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C TOS8P53147 276 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SNZ2P53824 298 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C TAF9Q05027 157 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SEC10Q06245 871 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C HEM25Q07534 307 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YDL144CQ07589 356 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C WTM1Q12363 437 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C TFC7Q12415 435 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C YMR230W-AQ3E7B5 62 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C BI3Q9ZZW7 517 aa2.78□□□□□ -1.96
HRD1YOL013C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C PDR11P40550 1411 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C STE7P06784 515 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data2.77□□□□□ -1.97not detected
HRD1YOL013C DBF2P22204 572 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C SRY1P36007 326 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C DBP7P36120 742 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YCR087C-AP37263 153 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C FZO1P38297 855 aa2.77□□□□□ -1.97
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