RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	EDS1	P38073	919 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SRO77	P38163	1010 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPB11	P38902	120 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	STE24	P47154	453 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PAU12	P53343	120 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YOR015W	Q12169	119 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RTN2	Q12443	393 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RIM15	P43565	1770 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YML003W	P0CF16	290 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CKA1	P15790	372 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SCO2	P38072	301 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	QRI7	P43122	407 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YGL114W	P53134	725 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YNR062C	P53748	327 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PLM2	Q04383	521 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MDM30	Q05930	598 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YDL086W	Q07505	273 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YOL029C	Q08187	201 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	AEP3	Q12089	606 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	FLO1	P32768	1537 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	STE18	P18852	110 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YCR101C	P25607	182 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TRS65	P32893	560 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YBR292C	P38357	123 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	BUD8	P41698	603 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TAD2	P47058	250 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MIX14	Q04341	121 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YMR252C	Q04814	134 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ENB1	Q08299	606 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PHO2	P07269	559 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CPR4	P25334	318 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PPA2	P28239	310 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ACH1	P32316	526 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PPZ2	P33329	710 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ECT1	P33412	323 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	POP7	P38291	140 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	POG1	P40473	351 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CCC1	P47818	322 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	BDS1	Q08347	646 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PST1	Q12355	444 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CNE1	P27825	502 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.04	□□□□□ -1.92	not detected
RRP5	YMR229C	CTS1	P29029	562 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PPQ1	P32945	549 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TED1	P40533	473 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	VMA21	P41806	77 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	LCL3	P53153	274 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TYW3	P53177	273 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GPI15	P53961	229 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	VPS28	Q02767	242 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ARO10	Q06408	635 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	NAT3	Q06504	195 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	BSC6	Q08280	497 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TGS1	Q12052	315 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MSB2	P32334	1306 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	DOA4	P32571	926 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SNC2	P33328	115 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CCZ1	P38273	704 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YDL186W	P48568	277 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MIC26	P50087	233 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	NPY1	P53164	384 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ROY1	Q04847	553 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ANT1	Q06497	328 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YDL176W	Q12027	708 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MHT1	Q12525	324 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	HO	P09932	586 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YCR061W	P25639	631 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CLG1	P35190	452 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	VRG4	P40107	337 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YJL043W	P47053	257 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YGL159W	P53110	370 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PEF1	P53238	335 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PIR3	Q03180	325 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YML079W	Q03629	201 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PLB2	Q03674	706 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	LPP1	Q04396	274 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	HLR1	Q04429	423 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TMS1	Q12116	473 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YDL177C	Q12257	170 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SCEI	P03882	235 aa		3.03	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms