RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	AZF1	P41696	914 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	PMT4	P46971	762 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	AIM23	P47015	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	INM2	Q05533	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SSK1	Q07084	712 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	STH1	P32597	1359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	COQ3	P27680	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TOD6	P34219	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TVP38	P36164	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	FRM2	P37261	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
HOF1	YMR032W	PCL5	P38794	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SER33	P40510	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MCM22	P47167	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	COS1	P53822	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	BNA5	Q05979	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	POM152	P39685	1337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	COX5A	P00424	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	EFM1	P38732	585 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MDM31	P38880	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	NVJ1	P38881	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TPN1	P53099	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SOL4	P53315	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TIM8	P57744	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TDA1	Q03533	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	BET5	Q03630	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	RUB1	Q03919	77 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	DIC1	Q06143	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	LDB18	Q07887	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	HIS3	P06633	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SPS100	P13130	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	INO2	P26798	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TIR2	P33890	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MRPL17	P36528	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	ECM14	P38836	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	EGT2	P42835	1041 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	HCH1	P53834	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	HSK3	P69852	69 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	ERD1	P16151	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	OCH1	P31755	480 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MST28	P39552	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YIL169C	P40442	995 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YFL064C	P43540	174 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	COG7	P53195	279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YNR048W	P53740	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	UBC7	Q02159	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MAK3	Q03503	176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	PEX11	Q12462	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	BPT1	P14772	1559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	PEP1	P32319	1579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	CAP2	P13517	287 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	GCN3	P14741	305 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	FMP23	P38231	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YIL067C	P40514	678 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	DFG10	P40526	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	GLC8	P41818	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SCS7	Q03529	384 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SEI1	Q06058	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	LOA1	Q06508	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	SNC1	P31109	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	UGX2	P32772	223 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	FRE2	P36033	711 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	MOB2	P43563	287 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	CPR7	P47103	393 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	PEX30	Q06169	523 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	TRM10	Q12400	293 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HOF1	YMR032W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29 ms