RNA–Protein interactions for RNA: YLR363C

NMD4, Transcript of Protein that may be involved in nonsense-mediated mRNA decay, yeast

Gene NMD4, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD4	YLR363C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SPO7	P18410	259 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	REC107	P21651	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	PHO89	P38361	574 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	POP2	P39008	433 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	FAR7	P43592	221 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	BNA6	P43619	295 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	ABM1	P47146	123 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	CGR1	P53188	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YGR016W	P53209	190 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SLM2	P53955	656 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	FDH1	Q08911	376 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	MHT1	Q12525	324 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YCR051W	P25631	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	PPQ1	P32945	549 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	TPO5	P36029	618 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	CAF4	P36130	643 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	ECM31	P38122	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YMR262W	P38430	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SEN34	P39707	275 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	AVT6	P40074	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	COX16	P47081	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	TOM22	P49334	152 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SKO1	Q02100	647 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	MMT1	Q03218	510 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	ATG34	Q12292	412 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	COS2	P0CX12	379 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	COS3	P0CX13	379 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	POP5	P28005	173 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SPO23	P33757	523 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	CLG1	P35190	452 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SBE22	P38814	852 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	CIN5	P40917	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	COS4	P43542	379 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	AGX1	P43567	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	AIM24	P47127	394 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	STE24	P47154	453 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	COS6	P53344	381 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	GAS3	Q03655	524 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	GPI17	Q04080	534 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SOR2	Q07786	357 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	MED2	Q12124	431 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YOS9	Q99220	542 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	STF1	P01098	86 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SCEI	P03882	235 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	CYC3	P06182	269 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	HXT2	P23585	541 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	MKK1	P32490	508 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	VAM7	P32912	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	AST1	P35183	429 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	JEM1	P40358	645 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	HPM1	P40481	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	FMP32	P43557	207 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	FMP33	P46998	180 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	MDE1	P47095	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	NAS6	P50086	228 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	GPI15	P53961	229 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	IRC25	Q07951	179 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	APC9	Q12107	265 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	MDM32	Q12171	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	STP22	P25604	385 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	OM14	P38325	134 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	TRR2	P38816	342 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	AIM2	P39721	246 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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