RNA–Protein interactions for RNA: YKL103C

APE1, Transcript of Vacuolar aminopeptidase yscI, yeast

Gene APE1, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APE1	YKL103C	KRE29	P40026	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YFH7	P43591	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	GWT1	P47026	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YGL082W	P53155	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	BSP1	Q06604	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	PNS1	Q12412	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	TFC7	Q12415	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	SPS100	P13130	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	SPS18	P32572	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	SPC34	P36131	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	ECM13	P38195	257 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YBP1	P38315	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	MST28	P39552	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	VPS52	P39904	641 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YJR056C	P47115	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	VPS25	P47142	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	OST3	P48439	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	POP6	P53218	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	APC1	P53886	1748 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	NUP49	Q02199	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	ABF2	Q02486	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	TAF9	Q05027	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	FKS3	Q04952	1785 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	CTS1	P29029	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	SGE1	P33335	543 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	WSC4	P38739	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	CIN5	P40917	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	ARK1	P53974	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	SPC24	Q04477	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	DPP1	Q05521	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	ORM2	Q06144	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	MMT2	Q08970	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	GLN3	P18494	730 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	PHO80	P20052	293 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	HCM1	P25364	564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	PDC2	P32896	925 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	AVT5	P38176	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	CYC2	P38909	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	RTS2	P40962	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	AVT4	P50944	713 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	JAC1	P53193	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YNR066C	P53752	436 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	PDR17	P53844	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YML096W	Q04489	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	GRX8	Q05926	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	PEX30	Q06169	523 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	TPO4	Q12256	659 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE1	YKL103C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	MRPL3	P36516	390 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	MTC6	P38849	526 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	TPN1	P53099	579 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	YET2	Q04210	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	INM2	Q05533	292 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	PRM4	Q12498	284 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	PET54	P10834	293 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	CDC43	P18898	376 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	IFM1	P25038	676 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	MOG1	P47123	218 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	SWS2	P53937	143 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	BSC1	Q12140	328 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	FRE8	Q12209	686 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	PCL9	Q12477	304 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	MGT1	P26188	188 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE1	YKL103C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
APE1	YKL103C	PHA2	P32452	334 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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