RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RBK1	P25332	333 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ADH7	P25377	361 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.32	□□□□□ -1.88	not detected
XRS2	YDR369C	ERG3	P32353	365 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	WSC4	P38739	605 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MET30	P39014	640 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SSN3	P39073	555 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YER121W	P40076	114 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MOB1	P40484	314 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	AVT7	P40501	490 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YIL012W	P40551	113 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	AIM25	P47140	327 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YGR053C	P53234	283 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RSM23	Q01163	450 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PEX29	Q03370	554 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SDH7	Q04401	133 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	IRC10	Q08118	586 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	JLP1	Q12358	412 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TRM13	Q12383	476 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RDI1	Q12434	202 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SIR2	P06700	562 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HVG1	P0CE11	249 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PAU19	P0CE85	124 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PAU21	P0CE86	164 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PAU22	P0CE87	164 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SAM35	P14693	329 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SRM1	P21827	482 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SGF29	P25554	259 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PAU3	P25610	124 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MRP17	P28778	131 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SEC17	P32602	292 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	UTR5	P32630	166 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	FMT1	P32785	401 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PHD1	P36093	366 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	UBS1	P38290	277 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YEA6	P39953	335 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	COX15	P40086	486 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	EMC5	P40540	141 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YFL012W	P43580	148 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HMS2	P47175	358 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	FRE4	P53746	719 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YNL260C	P53846	198 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RCE1	Q03530	315 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	CTR3	Q06686	241 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	THP1	Q08231	455 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NAT5	Q08689	176 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GRE1	Q08969	168 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ERS1	P17261	260 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ANB1	P19211	157 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SAG1	P20840	650 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SDH2	P21801	266 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YCR023C	P25351	611 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YCR099C	P25657	155 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GAC1	P28006	793 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	CDC5	P32562	705 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ATF1	P40353	525 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PRM2	P40534	656 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YJL132W	P47014	750 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MTO1	P53070	669 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TIM8	P57744	87 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SHS1	Q07657	551 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HUT1	Q12520	339 aa		3.31	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PAI3	P01094	68 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31 ms