RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641119.1

TNNT3-216, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 BASIC

Gene TNNT3, Length 941 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-216ENST00000641119 USP20Q9Y2K6 914 aa13.16□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 VWA3AA6NCI4 1184 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 CCDC169A6NNP5 214 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 PTGESO14684 152 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 TEX28O15482 410 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 SLC26A4O43511 780 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 BMP15O95972 392 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 C1RP00736 705 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 THP07101 528 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 PLA2G5P39877 138 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 ZXDAP98168 799 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 MAPK7Q13164 816 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 CUL4AQ13619 759 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 NAB2Q15742 525 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 PTPN21Q16825 1174 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 USP41Q3LFD5 358 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 KANK3Q6NY19 840 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 FUT10Q6P4F1 479 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 TRIM67Q6ZTA4 783 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 HFE2Q6ZVN8 426 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 BRAPQ7Z569 592 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 GPR149Q86SP6 731 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 AK8Q96MA6 479 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 PNMA5Q96PV4 448 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 GPR62Q9BZJ7 368 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 KCND2Q9NZV8 630 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 TNFSF13BQ9Y275 285 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 TECTAO75443 2155 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 WDFY4Q6ZS81 3184 aa13.15□□□□□ -0.3
TNNT3-216ENST00000641119 DENND4AQ7Z401 1863 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 TADA2AO75478 443 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 WEE2P0C1S8 567 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 CREMQ03060 361 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 MFSD14AQ96MC6 490 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 PAAF1Q9BRP4 392 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 KMT5AQ9NQR1 393 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 FNIP2Q9P278 1114 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 KCNG1Q9UIX4 513 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 USTQ9Y2C2 406 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 GDAQ9Y2T3 454 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 PLXNA3P51805 1871 aa13.14□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 TMEM221A6NGB7 291 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 CASTOR2A6NHX0 329 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 C2CD4DB7Z1M9 353 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 M0R296 226 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 KIF4AO95239 1232 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 GLUD1P00367 558 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 PDCP20941 246 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 SP100P23497 879 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 GRM5P41594 1212 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 SIGLEC14Q08ET2 396 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 ZNF568Q3ZCX4 644 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 TMEM119Q4V9L6 283 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 HDAC7Q8WUI4 952 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 SPIRE2Q8WWL2 714 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 RABGGTAQ92696 567 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 FAM122AQ96E09 287 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 B3GALT6Q96L58 329 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 CDT1Q9H211 546 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 PTPRHQ9HD43 1115 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 MAN1C1Q9NR34 630 aa13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 SLC16A4O15374 487 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 PAPLNO95428 1278 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 BRD1O95696 1058 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 PLA2G4BP0C869 781 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 MCF2P10911 925 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 PLS3P13797 630 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 PROZP22891 400 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 UBA7P41226 1012 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 SMTNP53814 917 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 SLC12A3P55017 1021 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 CCDC149Q6ZUS6 474 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 TAS1R3Q7RTX0 852 aa13.12□□□□□ -0.31
TNNT3-216ENST00000641119 ZBTB33Q86T24 672 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms