RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NTHL1P78549 312 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 AMHR2Q16671 573 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 RTP2Q5QGT7 225 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC27A1Q6PCB7 646 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PARM1Q6UWI2 310 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP57Q86XR8 500 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF14Q92915 247 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF20Q9BVI0 1012 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 GLULP15104 373 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PPM1LQ5SGD2 360 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SLFN12Q8IYM2 578 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTCDQ8NEC7 633 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 BCO2Q9BYV7 579 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXW11Q9UKB1 542 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF292O60281 2723 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 STARD6P59095 220 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 UBXN2BQ14CS0 331 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 CASTOR2A6NHX0 329 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL16O15467 120 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMTOR5O43504 91 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 DGAT1O75907 488 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 CDKL5O76039 1030 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 C8AP07357 584 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 POU5F1BQ06416 359 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMD5Q16401 504 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 MTSS1LQ765P7 747 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 TTPALQ9BTX7 342 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 KANSL1LA0AUZ9 987 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 XYLBO75191 536 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SLITRK3O94933 977 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SPIRE1Q08AE8 756 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 TUSC3Q13454 348 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM132AQ24JP5 1023 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM171A1Q5VUB5 890 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 OXER1Q8TDS5 423 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PAAF1Q9BRP4 392 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 NCDNQ9UBB6 729 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 GLRA2P23416 452 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL2P36404 184 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF13Q92913 245 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRIQ4A6NIV6 560 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PIK3R5Q8WYR1 880 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 CLSTN3Q9BQT9 956 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 GJB4Q9NTQ9 266 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKEF1Q9NU02 776 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 DOCK8Q8NF50 2099 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 USO1O60763 962 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF4AO95239 1232 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKCQQ04759 706 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC44A4Q53GD3 710 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 MAEAQ7L5Y9 396 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 KXD1Q9BQD3 176 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 NFKBIZQ9BYH8 718 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GUA9 196 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM170BA6NMN3 283 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PFKPQ01813 784 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 SUMF1Q8NBK3 374 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ITFG1Q8TB96 612 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A14Q8TBB6 771 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PDRG1Q9NUG6 133 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 DTNBO60941 627 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGOQ8TEQ8 1089 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ATRIPQ8WXE1 791 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO4Q9UKT5 387 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA12Q9UN75 941 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM205CA6NFA0 338 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTLC1O15269 473 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 LYPLA2O95372 231 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXA9P31269 272 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 RARRES1P49788 294 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 CALCRLQ16602 461 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PDXDC1Q6P996 788 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 DLL3Q9NYJ7 618 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WWV3 80 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM12O43184 909 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 THP07101 528 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 CD72P21854 359 aa30.27■■■□□ 2.44
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