RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628867.1

SPTAN1-215, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-215ENST00000628867 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 ELMOD1Q8N336 334 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 RABGGTAQ92696 567 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 DNASE1L2Q92874 299 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CCDC51Q96ER9 411 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 ZFP42Q96MM3 310 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 RNF39Q9H2S5 420 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CHRDQ9H2X0 955 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 MIOSQ9NXC5 875 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 HES2Q9Y543 173 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 ZNF197O14709 1029 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 SLC27A2O14975 620 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 ZNF263O14978 683 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 HRO43593 1189 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 AKAP5P24588 427 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 GDI1P31150 447 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 NLRP5P59047 1200 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 SHC2P98077 582 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 LRRC32Q14392 662 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 RTP2Q5QGT7 225 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 RTL10Q7L3V2 364 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 SLC5A5Q92911 643 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 GJA10Q969M2 543 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CPB2Q96IY4 423 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 KLK14Q9P0G3 267 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 ESYT2A0FGR8 921 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 PRRG1O14668 218 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 TRAPPC3O43617 180 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 PAPLNO95428 1278 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 RHOP08100 348 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CCDC192P0DO97 292 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 PSMC3P17980 439 aa8.48□□□□□ -1.05
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SPTAN1-215ENST00000628867 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 XKR9Q5GH70 373 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 IQCEQ6IPM2 695 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 ANO5Q75V66 913 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 POTEDQ86YR6 584 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 MTRQ99707 1265 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 CORO1BQ9BR76 489 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.48□□□□□ -1.05
SPTAN1-215ENST00000628867 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.48□□□□□ -1.05
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