RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	DSG2	Q14126	1118 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	NBR1	Q14596	966 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PLPP6	Q8IY26	295 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CHST12	Q9NRB3	414 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM232	C9JQI7	657 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061		F6X3S4	739 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	FLRT2	O43155	660 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	XYLB	O75191	536 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	LRG1	P02750	347 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RASA1	P20936	1047 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CYP7A1	P22680	504 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	FCAR	P24071	287 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PPP2R1A	P30153	589 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ZAP70	P43403	619 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CLDN6	P56747	220 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM160B2	Q86V87	743 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PALB2	Q86YC2	1186 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	MIB2	Q96AX9	1013 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TGM5	O43548	720 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CD97	P48960	835 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	SNAP25	P60880	206 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TIMM10	P62072	90 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM189B	P81408	668 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PTPRN	Q16849	979 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	UVSSA	Q2YD98	709 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ODR4	Q5SWX8	454 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	VIT	Q6UXI7	678 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	USP49	Q70CQ1	688 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF169	Q8NCN4	708 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	XAGE2	Q96GT9	111 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	SDK2	Q58EX2	2172 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ABCB11	O95342	1321 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061		B4E1Z4	1266 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CCL16	O15467	120 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	SEMA7A	O75326	666 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RPS6KA5	O75582	802 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CIAO1	O76071	339 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	GGPS1	O95749	300 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	C1R	P00736	705 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	UQCRFS1	P47985	274 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	DMC1	Q14565	340 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	STXBP2	Q15833	593 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ARNTL	O00327	626 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF40	O75150	1001 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ALDH1L1	O75891	902 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ICAM1	P05362	532 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	GALT	P07902	379 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CYP2D6	P10635	497 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PPFIA1	Q13136	1202 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	GORAB	Q5T7V8	394 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	HES3	Q5TGS1	186 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	LIN9	Q5TKA1	542 aa		7.35	□□□□□ -1.23

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