RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC12A3	P55017	1021 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	ITIH3	Q06033	890 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	TUSC3	Q13454	348 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC26A4	O43511	780 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLS3	P13797	630 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	STRN3	Q13033	797 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	FUT10	Q6P4F1	479 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZBTB33	Q86T24	672 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCND2	Q9NZV8	630 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDH22	Q9UJ99	828 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTGES	O14684	152 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	GRIN1	Q05586	938 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	B3GALT6	Q96L58	329 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLIC4	Q9Y696	253 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	LILRB3	O75022	631 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	WEE2	P0C1S8	567 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	OSTN	P61366	133 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	KANK3	Q6NY19	840 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPBP1	Q86WP2	473 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	HASPIN	Q8TF76	798 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	FBXL18	Q96ME1	805 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3B-215	ENST00000621029	C5orf42	Q9H799	3197 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPR37L1	O60883	481 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADH1A	P07327	375 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLCN4	P51793	760 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	REST	Q13127	1097 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP41	Q3LFD5	358 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDT1	Q9H211	546 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLCG1	P19174	1290 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTHFR	P42898	656 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	DSG1	Q02413	1049 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	TEX28	O15482	410 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARSH	Q5FYA8	562 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	CEP120	Q8N960	986 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	GRM5	P41594	1212 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MCM6	Q14566	821 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	CEP57	Q86XR8	500 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	POMK	Q9H5K3	350 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	CHST7	Q9NS84	486 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	NR2E1	Q9Y466	385 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM13A	O94988	1023 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIF4A	O95239	1232 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	EFEMP2	O95967	443 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYB	P10242	640 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MCF2	P10911	925 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms