RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617172.4

TARDBP-218, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-218ENST00000617172 POMKQ9H5K3 350 aa10.66□□□□□ -0.7
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TARDBP-218ENST00000617172 FNIP2Q9P278 1114 aa10.66□□□□□ -0.7
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TARDBP-218ENST00000617172 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
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TARDBP-218ENST00000617172 H0YCG3 227 aa10.62□□□□□ -0.71
TARDBP-218ENST00000617172 TGM5O43548 720 aa10.62□□□□□ -0.71
TARDBP-218ENST00000617172 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TARDBP-218ENST00000617172 BRD1O95696 1058 aa10.62□□□□□ -0.71
TARDBP-218ENST00000617172 PLS3P13797 630 aa10.62□□□□□ -0.71
TARDBP-218ENST00000617172 UBA7P41226 1012 aa10.62□□□□□ -0.71
TARDBP-218ENST00000617172 GRM5P41594 1212 aa10.62□□□□□ -0.71
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