RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	RASA4B	C9J798	803 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RASA4	O43374	803 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP9A	O75110	1047 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	NR3C2	P08235	984 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ITGB5	P18084	799 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449		Q4G0T1	1027 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	HSPH1	Q92598	858 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	GDF3	Q9NR23	364 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449		H0Y3Z8	333 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CHRNA3	P32297	505 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RARRES1	P49788	294 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MAPK7	Q13164	816 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SNCB	Q16143	134 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ENTPD3	O75355	529 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RALA	P11233	206 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CCND2	P30279	289 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	NPTX2	P47972	431 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	GPS1	Q13098	491 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CAVIN3	Q969G5	261 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PHF2	O75151	1096 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC5A5	Q92911	643 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MYH3	P11055	1940 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PODXL	O00592	558 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	STAM2	O75886	525 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PSAP	P07602	524 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP5D	P30049	168 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	UGCG	Q16739	394 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	VAV3	Q9UKW4	847 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449		H7C0C1	242 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM107A	O95990	144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP11B1	P15538	503 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CAP2	P40123	477 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP5O	P48047	213 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ITGA8	P53708	1063 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	INTU	Q9ULD6	942 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	GRAP2	O75791	330 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMD10	O75832	226 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SUN1	O94901	812 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	HLA-DRA	P01903	254 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ADRB2	P07550	413 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	DPEP1	P16444	411 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMC4	P43686	418 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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