RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599229.2

VLDLR-AS1-205, VLDLR antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VLDLR-AS1, Length 1,346 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PIGRP01833 764 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ALDH2P05091 517 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ABCD1P33897 745 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 IRS1P35568 1242 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 GRM5P41594 1212 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 LIG4P49917 911 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 OSTNP61366 133 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 TMEM169Q96HH4 297 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 TLR9Q9NR96 1032 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.52■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ANK1P16157 1881 aa20.51■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CLDN3O15551 220 aa20.51■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ASIC1P78348 528 aa20.51■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 DSC1Q08554 894 aa20.51■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 GRIK3Q13003 919 aa20.51■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.51■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.51■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 IGSF21Q96ID5 467 aa20.51■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 HPSEQ9Y251 543 aa20.51■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 A0A1W2PQ27 194 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 A0A1W2PQ64 194 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 A0A1W2PQD8 194 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PTGESO14684 152 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 NRP1O14786 923 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PPP1R37O75864 691 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 SLFN14P0C7P3 912 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 AFMP43652 599 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 OR1G1P47890 313 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ERVFC1P60507 584 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 MCL1Q07820 350 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 COASYQ13057 564 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 FSIP1Q8NA03 581 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 HVCN1Q96D96 273 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ACAP3Q96P50 834 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 STRA6Q9BX79 667 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.5■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 FSCN2O14926 492 aa20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 GCNT3O95395 438 aa20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 THP07101 528 aa20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CASP1P29466 404 aa20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 SYKP43405 635 aa20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 NDUFA8P51970 172 aa20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 USP25Q9UHP3 1055 aa20.49■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 TTC28Q96AY4 2481 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 MYBP10242 640 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CASP5P51878 434 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 SEZ6Q53EL9 994 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ACCSQ96QU6 501 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.48■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 NR1I2O75469 434 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 KCNA1Q09470 495 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 TUSC3Q13454 348 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 CUL4BQ13620 913 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 UNC13DQ70J99 1090 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 TMC7Q7Z402 723 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 HPS3Q969F9 1004 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 PAGE5Q96GU1 130 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 SNX27Q96L92 541 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 TCF25Q9BQ70 676 aa20.47■□□□□ 0.87
VLDLR-AS1-205ENST00000599229 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms