RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593168.5

VMP1-217, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene VMP1, Length 558 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-217ENST00000593168 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 GPD1LQ8N335 351 aa14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 HERVK_113Q902F9 699 aa14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 SLC35C1Q96A29 364 aa14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 IQCDQ96DY2 449 aa14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 NUP58Q9BVL2 599 aa14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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VMP1-217ENST00000593168 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.66□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 A0A0B4J269 797 aa14.65□□□□□ -0.06
VMP1-217ENST00000593168 TOM1L1O75674 476 aa14.65□□□□□ -0.06
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VMP1-217ENST00000593168 PTPN21Q16825 1174 aa14.65□□□□□ -0.06
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VMP1-217ENST00000593168 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.65□□□□□ -0.06
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VMP1-217ENST00000593168 PROZP22891 400 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-217ENST00000593168 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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VMP1-217ENST00000593168 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.64□□□□□ -0.07
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VMP1-217ENST00000593168 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.63□□□□□ -0.07
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VMP1-217ENST00000593168 MCL1Q07820 350 aa14.63□□□□□ -0.07
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VMP1-217ENST00000593168 AMHR2Q16671 573 aa14.63□□□□□ -0.07
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VMP1-217ENST00000593168 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.63□□□□□ -0.07
VMP1-217ENST00000593168 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.63□□□□□ -0.07
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VMP1-217ENST00000593168 P4HA2O15460 535 aa14.62□□□□□ -0.07
VMP1-217ENST00000593168 STX10O60499 249 aa14.62□□□□□ -0.07
VMP1-217ENST00000593168 GYPCP04921 128 aa14.62□□□□□ -0.07
VMP1-217ENST00000593168 IQCF3P0C7M6 154 aa14.62□□□□□ -0.07
VMP1-217ENST00000593168 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
VMP1-217ENST00000593168 FMO5P49326 533 aa14.62□□□□□ -0.07
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VMP1-217ENST00000593168 CCL23P55773 120 aa14.62□□□□□ -0.07
VMP1-217ENST00000593168 CYP24A1Q07973 514 aa14.62□□□□□ -0.07
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