RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 CGRRF1Q99675 332 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 B4GALT5O43286 388 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTS4O75173 837 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR32O75388 356 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 GNAT1P11488 350 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 STAT1P42224 750 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 AP3M2P53677 418 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.545e-8■■■□□ 17.3
CAPNS1-207ENST00000589146 SURF1Q15526 300 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 GJB7Q6PEY0 223 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SV2AQ7L0J3 742 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXL13Q8NEE6 735 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF516Q92618 1163 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 FNBP1Q96RU3 617 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 TCHPQ9BT92 498 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 HMGCRP04035 888 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 MCF2P10911 925 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP2C9P11712 490 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 FERP16591 822 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 WNT7BP56706 349 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZACNQ401N2 412 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 GNASQ5JWF2 1037 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB33Q86T24 672 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP7Q8WX94 980 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SEMA4DQ92854 862 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ERO1AQ96HE7 468 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR88Q9GZN0 384 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CDT1Q9H211 546 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 F8VZ95 297 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SOX5P35711 763 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF11P52732 1056 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ETF1P62495 437 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 NME8Q8N427 588 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB20Q9NX57 234 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ELNP15502 786 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP25P42331 645 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PRMT2P55345 433 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF6Q15052 776 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 KYAT1Q16773 422 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM81BQ96LP2 452 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF263O14978 683 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPAN1O60635 241 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 FKTNO75072 461 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SPA17Q15506 151 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR49Q8IV35 697 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF19Q8IW93 802 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 C7orf31Q8N865 590 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 DEF6Q9H4E7 631 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GUA9 196 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TREHO43280 583 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR1B10O60218 316 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 GFPT2O94808 682 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PGK1P00558 417 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC172P0C7W6 258 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TNNI1P19237 187 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFSF9P41273 254 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SESTD1Q86VW0 696 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 HELQQ8TDG4 1101 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 NT5C1BQ96P26 610 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 HAUS4Q9H6D7 363 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRJQ12913 1337 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 B4GALT4O60513 344 aa24.61■■□□□ 1.53
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