RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TET3O43151 1660 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 CDH6P55285 790 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 STXBP3O00186 592 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 APOL1O14791 398 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 GPSM2P81274 684 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 CUL3Q13618 768 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 GGT7Q9UJ14 662 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TYK2P29597 1187 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 HIF1AQ16665 826 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 GNAT1P11488 350 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SZRD1Q7Z422 152 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SRGNP10124 158 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 NFKBIAP25963 317 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SLC1A1P43005 524 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 RNF135Q8IUD6 432 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ATL2Q8NHH9 583 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 WRNIP1Q96S55 665 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SCP2P22307 547 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 DAB2P98082 770 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 FLOT2Q14254 428 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ULK4Q96C45 1275 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM9Q9C026 710 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 BFARQ9NZS9 450 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 E5RI56 91 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF6Q15052 776 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TRABDQ9H4I3 376 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 HDAC4P56524 1084 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SKOR1P84550 965 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PDIA5Q14554 519 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SLC18A3Q16572 532 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 FAM205CA6NFA0 338 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 AGTP01019 485 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 AKR1B1P15121 316 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 RBBP7Q16576 425 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 AGR3Q8TD06 166 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC90BQ9GZT6 254 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 KIF17Q9P2E2 1029 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 RAP1GDS1P52306 607 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 EPHA7Q15375 998 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ADSSL1Q8N142 457 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 CHN1P15882 459 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PHF2O75151 1096 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R37O75864 691 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 AP3M2P53677 418 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 A8MXQ7 604 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 NR1I3Q14994 352 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PODNQ7Z5L7 613 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SP110Q9HB58 689 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PIK3R2O00459 728 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF609O15014 1411 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 IL17RAQ96F46 866 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ACAP3Q96P50 834 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8RI6L899 631 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 KCNJ6P48051 423 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 DDIASQ8IXT1 998 aa22.53■■□□□ 1.2
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