RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572083.5

CCDC40-206, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-206ENST00000572083 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 TADA2AO75478 443 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 NPTXRO95502 500 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 CAPSQ13938 189 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 GALNT17Q6IS24 598 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 NEK8Q86SG6 692 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 POTEDQ86YR6 584 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 GPR65Q8IYL9 337 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 PARP2Q9UGN5 583 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 CCL16O15467 120 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 LAMTOR5O43504 91 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 MARCH6O60337 910 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 PSMA5P28066 241 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 TFDP1Q14186 410 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 LIN9Q5TKA1 542 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 FGF13Q92913 245 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 BCO2Q9BYV7 579 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 NCDNQ9UBB6 729 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 POLIQ9UNA4 740 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 ZFHX4Q86UP3 3567 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 C8AP07357 584 aa22.05■■□□□ 1.12
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CCDC40-206ENST00000572083 CD72P21854 359 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 STK3Q13188 491 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 MTSS1LQ765P7 747 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 TPH2Q8IWU9 490 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 KXD1Q9BQD3 176 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.04■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 SPTLC1O15269 473 aa22.04■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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CCDC40-206ENST00000572083 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.04■■□□□ 1.12
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CCDC40-206ENST00000572083 ITFG1Q8TB96 612 aa22.04■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 TTPALQ9BTX7 342 aa22.04■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.04■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.04■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 TBX3O15119 743 aa22.03■■□□□ 1.12
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CCDC40-206ENST00000572083 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
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CCDC40-206ENST00000572083 POU5F1BQ06416 359 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.03■■□□□ 1.12
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CCDC40-206ENST00000572083 RUFY3Q7L099 469 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 CACNA1BQ00975 2339 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 FAM170BA6NMN3 283 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 SLITRK3O94933 977 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 ARL2P36404 184 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 TUSC3Q13454 348 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 OXER1Q8TDS5 423 aa22.02■■□□□ 1.12
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CCDC40-206ENST00000572083 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC40-206ENST00000572083 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.02■■□□□ 1.12
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CCDC40-206ENST00000572083 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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CCDC40-206ENST00000572083 ING5Q8WYH8 240 aa22.01■■□□□ 1.11
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CCDC40-206ENST00000572083 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCDC40-206ENST00000572083 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.01■■□□□ 1.11
CCDC40-206ENST00000572083 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CCDC40-206ENST00000572083 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCDC40-206ENST00000572083 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.01■■□□□ 1.11
CCDC40-206ENST00000572083 DGAT1O75907 488 aa22■■□□□ 1.11
CCDC40-206ENST00000572083 KRT37O76014 449 aa22■■□□□ 1.11
CCDC40-206ENST00000572083 HOXA9P31269 272 aa22■■□□□ 1.11
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