RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 KIF2CQ99661 725 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 NT5C3AQ9H0P0 336 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 MAN1C1Q9NR34 630 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 CHST7Q9NS84 486 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 MIOSQ9NXC5 875 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 KLK14Q9P0G3 267 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 FNIP2Q9P278 1114 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 YARSP54577 528 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 PTPN5P54829 565 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 SNTG2Q9NY99 539 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC169A6NNP5 214 aa18.28■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 GSTCDQ8NEC7 633 aa18.28■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.28■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 PIDD1Q9HB75 910 aa18.28■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa18.28■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa18.28■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 MUC6Q6W4X9 2439 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 TRAPPC3O43617 180 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 RECQL4O94761 1208 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 EFEMP2O95967 443 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 WEE2P0C1S8 567 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 SMTNP53814 917 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 BSNDQ8WZ55 320 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 UROC1Q96N76 676 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 TTPALQ9BTX7 342 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM134Q9H6X4 195 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 KMT5AQ9NQR1 393 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 KCND2Q9NZV8 630 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 LIMD1Q9UGP4 676 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 H0YCG3 227 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 PEX3P56589 373 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 NBR1Q14596 966 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 TAS1R1Q7RTX1 841 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 ASIC4Q96FT7 647 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 TMX3Q96JJ7 454 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 GPR62Q9BZJ7 368 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 GDAQ9Y2T3 454 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 SLC26A4O43511 780 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 BMP15O95972 392 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 STRN3Q13033 797 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 ECM1Q16610 540 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 LIN9Q5TKA1 542 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 PALB2Q86YC2 1186 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 NXPE3Q969Y0 559 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 TCHPQ9BT92 498 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 CDH22Q9UJ99 828 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 TECTAO75443 2155 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 E9PMD0 336 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 TGM5O43548 720 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 HIP1RO75146 1068 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 SCP2P22307 547 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 GJB2P29033 226 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 NPTX2P47972 431 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 NHLH1Q02575 133 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 TDGQ13569 410 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 FAM171A1Q5VUB5 890 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 CEP57Q86XR8 500 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 AK8Q96MA6 479 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 KIFC3Q9BVG8 833 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 PTGESO14684 152 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 GUCY2CP25092 1073 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 AVPR2P30518 371 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 PSMD5Q16401 504 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 RINT1Q6NUQ1 792 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 KANK3Q6NY19 840 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-211ENST00000568829 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms