RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF778	Q96MU6	729 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	MCM8	Q9UJA3	840 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957		H7C1D1	291 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MTSS1	O43312	755 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MATN4	O95460	622 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ESRRB	O95718	433 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FGA	P02671	866 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	JMJD7	P0C870	316 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9A1	P19634	815 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX5	P35711	763 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	BCAR1	P56945	870 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	POU5F1B	Q06416	359 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP2R5A	Q15172	486 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PCGF5	Q86SE9	256 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	TMTC2	Q8N394	836 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NINJ1	Q92982	152 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD3	Q96ES6	412 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	DYDC2	Q96IM9	177 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR92	Q96MX6	357 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX7	Q9BT81	388 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NDC1	Q9BTX1	674 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CABP5	Q9NP86	173 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SWAP70	Q9UH65	585 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAI1	Q9UI46	699 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0A6YYJ9	748 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	E2F8	A0AVK6	867 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC189	A1A4V9	331 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	STC2	O76061	302 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PTTG1IP	P53801	180 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF174	Q15697	407 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NME9	Q86XW9	330 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP26	Q9BV47	211 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMAT4	Q9H898	229 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CASS4	Q9NQ75	786 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	OXSM	Q9NWU1	459 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PNMA2	Q9UL42	364 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087X0B3	334 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CGB1	A6NKQ9	187 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOC5	O00471	708 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	OPHN1	O60890	802 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QL1	O75973	258 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NCR1	O76036	304 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ASMTL	O95671	621 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CNGA1	P29973	690 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PLA2G5	P39877	138 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	GUCY1B3	Q02153	619 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MCL1	Q07820	350 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCY2	Q08462	1091 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MORC3	Q14149	939 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	BRD3	Q15059	726 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NXN	Q6DKJ4	435 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF425	Q6IV72	752 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NIM1K	Q8IY84	436 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PPM1E	Q8WY54	764 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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